Mário Jorge Samara Logan foi um lendário Cavaleiro Jedi que ajudou a derrotar o Terceiro Império Galáctico na Terceira Guerra Civil Galáctica e ajudou a formar a República Federativa da Galáxia, assim como a Nova Ordem Jedi.
Nascido em algum ponto em 132 anos ABMC filho da Amazona Jedi caída Maria Isabel Samara e o do Príncipe de Gondor Tomé Gabriel Logan, e irmão gêmeo de Luigi Samara Logan. Assim como o irmão de Rock Samara Logan, de Jeferson Samara Logan, de Sara Liliana Samara Logan, de Goku Samara Logan, de Samus Aramovich Samara Logan, de Asher Ketchun Samara Logan, de Milena Nayame Samara Logan e de Artur Link Samara Logan. Ele foi levado para Olrox e escondido do Imperador José Fobos e de sua mãe, que agora tinha se tornado Darth Mama, a Lady Negra dos Sith. Durante a época da Batalha do Monumento Central, a vida de Mário mudou para sempre. Após a compra de dois robôs, R2-D2 e C-3PO que o levaram para receber treinamento nos caminhos da Força com a Mestra Jedi Liana May Xiang e para ajudar Han Solo e a Princesa Sara Liliana, que era, sem que ele soubesse, a sua irmã mais velha. Mário então destruiu o Primeiro Núcleo de Fantomile e se juntou à República de Maria Isabel Samara.
Ao longo dos próximos anos, ele lutou em muitas das mais importantes batalhas da Terceira Guerra Civil Galáctica, ajudando a fundar o Esquadrão Asa Valente e lutar contra as Forças do Terceiro Império em toda a Galáxia. Em 4 anos DBMC, Mário recebeu treinamento Jedi do Grande Mestre Jedi Yoda e soube que a Lady Sith Darth Mama era sua mãe verdadeira. Um ano mais tarde, lutou durante a Batalha de Romano onde foi o responsável por influenciar Darth Mama e trazê-la volta para a luz. Graças a Mário, o Imperador José César Fobos foi morto, iniciando o caminho para a queda do Terceiro Império Galáctico e a formação da República Federativa da Galáxia um ano depois.
Ao longo da década seguinte, Mário ajudou a manter a paz em toda a Galáxia como a República Federativa da Galáxia um lentamente derrotando o pequeno Remanescente de Fobos. Quando o Imperador Fobos retornou com vários corpos clone, Mário temporariamente caiu para o Lado Negro e se tornou Aprendiz do ressuscitado Imperador, mas mais tarde ele foi resgatado com a ajuda de seus amigos, e ele continuou com seu objetivo de reviver a Ordem Jedi. Em 12 anos DBMC, ele fundou a Nova Ordem Jedi, e começou a ensinar aos sensitivos a Força sobre os caminhos da Força no Praxeum Jedi, cumprindo seu destino como o primeiro dos novos Jedi. Em meio a esse renascimento veio com inúmeros desafios para Mário e seus aprendizes, incluindo a Frota de Crises Negras, a Revolta Almaniana, e a atração de Waru, mas Mário Logan, sendo auxiliado por companheiros Jedi e seus amigos, foi capaz de superar cada tentativa. Entretanto, após uma longa série de relacionamentos fracassados, Mário casou-se com a Jedi e companheira e ex-Mão do Imperador Mara Jade em 20 anos DBMC.
Vários anos após o encerramento da Terceira Guerra Civil Galáctica, Mário Jorge foi novamente colocado na linha de frente como o líder da Nova Ordem Jedi durante a Guerra Yuuzhan Vong, com a invasão das espécies extragalácticas Yuuzhan Vongs. Durante a guerra, a esposa de Mário Logan deu à luz um filho, que deram o nome de Benjamin Logan em homenagem aos avôs de Mário. Mário sofreu com as inúmeras batalhas com a República Federativa da Galáxia e caiu de costas, com a queda de sua casa em Coruscante. No entanto, o recém-formado governo, que se auto-intitulou como a Federação Galáctica de Alianças Livres, reagrupou seus aliados e ajudaram a recuar os invasores alienígenas. Nos estágios finais da guerra, Mário procurou o mundo vivo de Zonama Sekot, convencendo o planeta a aderir à Aliança Galáctica para uma batalha final em Coruscante, onde Mário liderou pessoalmente o ataque à cidadela do Líder Supremo Shimrra Jamaane e o matou, derrotando os Yuuzhan Vongs e acabando com a guerra.
Após a Guerra Yuuzhan Vong, Mário Jorge manteve um papel de destaque entre os Jedi durante a Crise do Ninho Negro, que viu uma chamada convocatória Jedi para lidar com conflitos internos da Ordem. Confrontado com a desunião, Mário assumiu o título de Grande Mestre e teve o controle direto sobre o restabelecimento do Conselho Jedi. Apesar do tratamento bem sucedido da Crise do Ninho Negro e a Guerra Enxame, uma paz duradoura ainda estava para ser alcançada, como a Quarta Guerra Civil Galáctica deflagrou alguns anos depois. Mário mergulhou em um período negro mais tarde com seu sobrinho, Jacinto Solo, que se tornou um Aprendiz Sith sob a guarda de sua antiga adversária Lady Lumiya e matou sua amada Mara. Sua dor foi agravada pelo seu filho sendo sugando pelo Lado Negro também, mas ele continuou a liderar os Jedi, formando a Coligação Jedi para se opor a seu sobrinho e seu governo da Aliança, agora um Lorde Sith com nome de Darth Caedus. Com a ajuda de Mário, Caedus foi morto por sua irmã gêmea Jaina, marcando o fim da guerra e restaurando a paz na Galáxia.
No rescaldo da guerra, a Chefe do Estado Natasi Daala ascendeu ao cargo de Chefe de Estado e promoveu uma ampla disseminação do sentimento Anti-Jedi, resultando as tensões entre a Ordem Jedi e seu governo. Daala finalmente teve Mário Jorge preso por precaução e, em troca de sua liberdade, ele foi exilado e proibido de se envolver nos assuntos da Ordem Jedi. Mário Jorge e o seu filho depois embarcaram em uma odisséia através da Galáxia para descobrir as causas da queda de Jacinto Solo para o Lado Negro. Durante sua jornada, os dois encontraram a misteriosa Última Tribo Sith, bem como uma entidade maligna do Lado Negro conhecido como Abeloth, e Mário tentou impedir um desastre que pudesse comprometer a Galáxia. Mário está idoso e não há novos dados sobre ele ou sobre seus irmãos. Sua mãe aparece para ele e seus irmãos ecoando na Força agradecendo a eles pelo que fizeram, sendo assim eles decidem seguir o eco da voz da mãe pela Galáxia. Depois disso ele e seus irmãos, inclusive Samus, desaparecem numa tempestade de areia em um sistema remoto e se tornam um só com a Força.
Talvez devido ao seu poder incrível com a Força, Mário Jorge foi objeto de várias profecias. Milhares de anos antes de seu nascimento, Mário Jorge apareceu em uma visão para o Mestre Jedi Q'Anilia, juntamente com a sua mãe Maria Isabel Samara (Como Darth Mama) e seu descendente Cade Samara, bem como Zayne Carrick e Naga Sadow; todos os cinco indivíduos seriam mais tarde afetados pelo Talismã Muur. A visão também mostrava Karness Muur, centenas de Rakghoulos e Orcs, e uma cidade em chama. Por volta de 990 anos ABY, Mestre Bodo Baas predisse que Mário e seus irmãos lutariam contra o Palpatine renascido em 11 anos DBMC.
Perto de 230 anos ABY uma nave de treinamento Jedi, o Chu'unthor, pousou no planeta Dathomir. O Mestre Jedi Yoda, juntamente com outros Jedi, enfrentou as Feiticeiras de Dathomir. Chegando a um impasse, ele concordou em deixar as caixas de dados da nave, embora não deixaram de analisá-las. As caixas foram levadas para Rell do Clã da Montanha Cantante para a apreensão dos dados, até essa altura, previa Yoda, que um Jedi viria para salvar o planeta da escuridão e a informação poderia ser seguramente compartilhada com as Feiticeiras. Mário Jorge, o último discípulo de Yoda, encontrou seu caminho para Dathomir e cumpriu a profecia de seu Mestre.
Em 132 aos ABMC, a Amazona Jedi Sha-Koon duelou, e foi derrotada por, Darth Mama. Como ela morreu, Koon teve uma visão através da Força de uma rebelião contra o Terceiro Império Galáctico, o retorno do Jedi em Mário Jorge Samara Logan, Mama se redimiu por seus filhos, matando o Imperador José Fobos, e o renascimento da Ordem Jedi por Mário Jorge. Percebendo que o futuro não dependia dela, Koon morreu em paz.
Mário Jorge Samara Logan nasceu no planeta Coruscante, pouco antes do início do Quarto Grande Purgo Jedi e a fundação do Terceiro Império Galáctico em 132 anos ABMC. Momentos depois de seu nascimento, seu irmão gêmeo Luigi Samara Logan nasceu. Meses depois, seu pai morreu, deixando órfãos de forma eficaz dez filhos.
Liana May Xiang e Yoda sabiam que as crianças, ambas dotadas de uma afinidade natural com a Força, deveriam ser protegidas de José Fobos e da mãe. Decidindo que seria melhor que as crianças fossem todas separadas, Elrond decidiu levar a menina mais velha Sara Liliana Samara Logan para Valdenda, afirmando que sua mulher sempre quis ter uma filha. Asher Ketchun foi levado sob os cuidados da irmã adotiva de Maria Samara, Judite Ketchun. Samus Aramovich Samara Logan foi levada pelo avô Guilherme Aragorn Logan para a Colônia Espacial K-2L e adotada pelo casal de mineiros Virgínia Aramovich e seu esposo Rodney Aramovich. Milena Nayame Samara Logan dada a um mutante com capacidade de Teletransporte chamado Cadu. Artur Link Samara Logan foi levado por Elrond para o planeta Hyrule sob os cuidados da Grande Árvore Deku. Rock Samara Logan foi levado para um laboratório onde esteve sob os cuidados de Doutor Tomé Luz e do Replóide Zero. Goku Samara Logan foi levado pelo avô para um planeta e Jeferson para outro. Os dois menores Mário Jorge e Luigi foram enviados para viver com o seu primo, Paulachada, filho do irmão de sua mãe e a esposa dele, Mariana Mário, em Olrox.
Liana levou duas as crianças para Olrox, pessoalmente, dando o seu primeiro passo em Nar Shaddaa, onde ela vendeu o Caça Estrelar do Grande General Nikrayos para comprar passagem para a terra natal da família Mário. Querendo observar o crescimento de Mário Jorge, Liana May decidiu morar escondida em Olrox e viver perto da criança.
Durante os primeiros anos do seu exílio, Liana May visitou os irmãos Mário todos os dias, sempre tentando ficar longe da vista de Paulachada e Mariana, para que eles não pudessem vê-la observando Mário Jorge. Posteriormente a intervenção de Liana nos negócios da família Mário fariam sua presença ser indesejada no lar dos Mário, o que fez Liana May parar de observar Mário Jorge diariamente. Uma vez Mário, fez o seu primeiro uso da Força foi quando ele tinha mais ou menos seis anos e, através da Força, localizou uma chave de fenda perdida que estava sob o sofá. Ele foi severamente repreendido pelo seu tio, com o argumento de que ele só poderia ter conhecido a sua localização, porque ele colocou lá, e depois, aprendeu a não fazer mais isto.
Quando Mário Jorge tinha dez anos de idade, ele fugiu de casa, furioso por Mariana se recusar a falar sobre a sua mãe. Infelizmente, Mário Jorge se perdeu em uma violenta tempestade. Na chuva fria durante a noite, ele teve uma visão de um vulto alto, e logo após conheceu uma garota chamada "Mara" de aproximadamente 17 anos. Ambas as crianças perceberam que tinham muito em comum: ambos sabiam pouco sobre suas mães, eram ótimos pilotos, ambos queriam sair de Olrox algum dia, e que ela poderia sentir eventos futuros. Logo, ambos acharam um Kremlingo enterrado na areia e tomaram dele sua arma. Logo após, eles foram se abrigar em uma Caverna Cogumelo próxima, mas foram afugentados por insetos de volta para a tempestade, aonde eles encontraram um dróide astromecânico vermelho e branco. Mara fez com que o dróide explodisse com a sua mente, o que chamou a atenção de uma Mãe Cogumelo que atacou as crianças. Mário perdeu Mara de vista por causa da escuridão e, por instinto, matou a Mãe Cogumelo atirando a arma do Kremilingo em sua garganta. Exausto, Mário ficou inconsciente, mas, felizmente, Mariana e um grupo de resgate o encontraram. No entanto, não havia nenhum sinal da Mãe Cogumelo e muito menos de Mara. Mário e Luigi, no entanto, estavam certo de que tudo aquilo não era um sonho, e Mariana sabia que havia algo de especial no seu sobrinho.
No que foi, possivelmente, o primeiro encontro que Mário Jorge se lembra de ter tido com Liana, foi quando Mário e Toad cruzaram a Vila dos Smurfs com o veículo de Mário, um Céuflutuante M-17 em busca de alguns ratos para poderem fazer um almoço. Não conseguindo, os dois tiveram que fugir de Tropas Koopas e fazerem os Goombas desistirem de roubar o Céuflutuante de Mário. Fazendo acampamento em uma caverna, eles foram encurralados por uma Mãe Cogumelo, mas Liana chega e a persegue. Então, eles domam um Yoshi, e os três Logan, Liana e Toad retornam a fazenda dos Samara.
Às vezes, durante sua adolescência, Mário Jorge foi desafiado para uma corrida de veículos rápidos por um fanfarrão local, Gorm Maldorf, para a A Gaiola. Na manhã da corrida, o corpo decapitado de Gorm foi encontrado em A Gaiola. Logan começou sua própria investigação sobre a morte, e com a ajuda de Liana May, ele deduziu que Gorm tinha sido morto acidentalmente por seu companheiro Chester na noite anterior, durante a tentativa de fraudar a corrida de A Gaiola.
Mário Logan e seu irmão Luigi passaram os primeiros 20 anos de sua vida na fazenda de trigo dos Samara, onde seu tio tentou sem sucesso desencorajar todas as suas tendências aventureiras. Isto gerou atritos entre os dois por causa da natureza ousada de Mário em conflito com o sensível e calmo Paulachada. Quando adolescente Mário sonhava com aventuras além de Olrox, o que o fazia entrar em choque sobre seu desejo de voar entre as estrelas de mundos distantes. Quando Mário fazia perguntas relativas sobre o envolvimento de sua mãe nas Guerras Replóides, Paulachada lhe dizia que sua mãe havia sido uma simples "Piloto de uma nave de comércio". Apesar desta leve decepção, Mário se tornou um jovem em busca de aventuras, pilotando sua Incom Céuflutuante M-17 pelos vários locais de Olrox como a Cidade Esmeralda, tendo pouca consideração com sua própria segurança. Além de compartilhar a habilidade natural de sua mãe para pilotagem, Mário desenvolveu um talento todo especial para reparos mecânicos enquanto cuidava de dróides e as máquinas na fazenda de trigo.
Mário tinha um grupo de amigos com esta mesma mentalidade em Olrox, entre os quais ele ganhou o apelido de "Saltador." Este grupo incluía Toad, seu irmão Luigi, Yoshi e um Smurf, cujos horizontes se entendiam muito além de Olrox, e o "Canhão" apelido de Nugget Bigfats, que compartilhava o sonho de Mário em se juntar à Academia do Terceiro Império e se tornar um piloto. Bigfats foi talvez o amigo mais próximo Mário e de Luigi, que ele olhava como um segundo irmão além de Luigi. Bigfats foi para a Academia em 1 anos ABMC, para o grande orgulho de Mário, como também seu ciúme e desespero. Quanto mais amigos de Mário Samara Logan deixavam o planeta para seguir seus sonhos, ele se tornava cada vez mais frustrado pelo fato de que seu tio não permitiria que ele saísse, alegando que ele ainda precisava ajudá-lo com a fazenda. Mas na verdade, Palachada estava tentando evitar que Mário e Luigi de seguissem os mesmos passos que sua mãe.
Antes de ir visitar o Reino do Cogumelo ou se tornar um fazendeiro, ele tinha que salvar as sua namorada Paulina das garras do gigante Wookiee Chewbacca, que a raptou de sua fazenda de gado. Usando arados e outras ferramentas, Mário finalmente resgata Paulina de Chewbacca o derrotando e o prendendo em uma jaula. Mário, involuntariamente, maltratou o Wookiee, colocando-o em um circo. No circo Chewbacca tinha que usar as pernas para se equilibrar em um barril, fazer malabarismos com abacaxis e evitar chamas mortais. O filho de Chewbacca, Lumpy veio para resgatá-lo de Mário e conseguindo a liberdade de seu pai.
Ao comprar dois dróides para o tio, a vida do jovem Mário Logan e de seu irmão Luigi mudariam para sempre. Com a descoberta de uma mensagem desesperada para Liana May contida dentro do dróide astro-mecânico R2-D2, Mário logo se viu na companhia de Liana após ser atacado por Tropas Koopas. Liana então revela a Mário e a Luigi que ela tinha sido uma Amazona Jedi que serviu nas Guerras Replóides com a mãe de Logan. Ela passa a informação para Mário e a Luigi que a sua mãe não era uma piloto de carga, mas uma Amazona Jedi morta por Darth Mama. Liana entregou o Sabre-de-Luz pertencia a sua mãe, que encontrou após o duelo em Romano.
Uma vez contaram para Mário sobre as Guerras Oxanas e como os Koopas eram maus, a divisão do mundo em duas partes: Entre a descendente da Rainha Branca, chamada de Peach e recebendo o titulo de Princesa Cogumelo, embora fosse uma Humana e o Reino da União Koopa. O primeiro objetivo de Mário para os Toads era resgatar a Princesa Cogumelo (Que se revela mais tarde como o Princesa Peach) de Bowser, a líder da União Koopa tentando pegar a suas propriedades. Alguns inimigos como Goombas e Koopas aparecem para tentarem derrotar Mário, mas são todos dderrotados pelo encanador. Aqui Mário usa seus poderes com a Força, inclusive comendo os Cogumelos da Força as vezes quando era ferido. Ele também podia lançar fogo atráves de um poder estranho. Ele luta também contra Bowsers falsos. Mário também pode se tornar invencível se conseguir uma estrela mágica.
Imediatamente após a derrota da líder da União Koopa Koopa e o resgate da Princesa Peach, Bowser havia seqüestrado ela novamente e invadiu o Reino do Cogumelo. Mário e Luigi tem que resgatar a princesa Toadstool de Bowser pela segunda vez, viajando em novas vários diferentes terras do Reino do Cogumelo derrotar mais da Tropa Koopa e os Bowsers falsos. Meses depois, Máriao agora com o seu irmão Luigi viajam através de oito reinos, em que os reis foram transformados em monstros pelos filhos de Bowser e os herdiros ao trono em Koopan, chmados de Koopalingos. Eventualmente, Toadstool é raptada, e os irmãos Samara a salvam de Bowser no momento final.
Mário vai passar umas férias em Koopan tentando derrotar Bowser, mas ele vai até o Reino do Cogumelo e raptar Peach mais uma vez, desta vez com a ajuda de de Yoshi, um habitante de Koopan. Mário e Luigi vão resgatá-la novamente ele lá ele adquire sua pena para voar por um curto período de tempo e ativa os cinco Chips de Ativação: Amarelo, Púrpura, Vermellho, Azul e Verde. Mário e Luigi derrotam os Koopalingos em seus castelos, resgatar os ovos capturados dos Yoshi, e derrotam Bowser no Vale de Bowser, resgatando Peach e voltando para o lar na Ilha do Yoshi.
Um ano depois, Mário é convidado a comer um bolo com a Princesa Peach em seu castelo na Vila Toad, mas encontra o castelo tomado e Peach raptada por Bowser quando ele chega lá. Quando enfrenta Bowser, Mário pega sua cauda e gira em torno dele para jogá-lo fora da plataforma de luta. Depois de a ter resgatado, Peach beija Mário e ele assa o bolo. Mes depois. Mário é mais uma vez convidado para o castelo de Peach para cortar o bolo junto com Wário e Luigi. No entanto, algum tempo depois de entrar, o castelo foi capturado novamente por Bowser. Os três saem e as portas são trancadas, Mário sendo é selado por Goomboss, que mantinha a chave de sua porta. Yoshi, que não foi capturado, porque ele estava dormindo no telhado do castelo, conseguiu encontrar um caminho até Goomboss, o derrotando e abrindo as portas para Mário com a chave que recebeu.
A partir de então, Mário com Yoshi, Luigi e Wário, vão resgatar a Princesa Peach. Eles também ativam os Chips de Ativação: Verde, Amarelo, Azul e Vermelho que estavam espalhados por todo o castelo. Usando suas halidades e com alguma ajuda dos Toads, eles resgatam Peach e derrotam Bowser e a União Koopa mais uma vez.
Mário Jorge Samara Logan, mais uma vez é convidado ao Castelo da Princesa Peach. No entanto, agora destaa vez Mário é convidado para uma festa fora no castelo. Mário Jorge estava indo ás pressas para o castelo, indo antes dos convidados até a festa agitada, e estava conversando com a Princesa Peach na sala do trono. No entanto, Bowser invade o castelo, levando-a para o alto. Ele e Kammy Koopa entram o castelo pela janela e usando o poder da Estrela Rod, derrotam Mário Jorge. Ele, então, joga Mário Jorge para fora da janela quebrada. Mário Jorge Samara Logan cai na terra de uma pequena floresta localizada nos arredores da Vila Goomba. Goombas, sendo um inimigo comum em muitas de suas missões, surpreendem Mário com sua hospitalidade. Mário dá seus muitos agradecimentos e volta para a Vila Toad pela Estrada Goomba, juntamente com o filho mais velho da família de Goombas, o jovem aventureiro Goombário.
Mário Jorge ouve uma Estrela Espiritual chamada Velhaestrela pedindo por sua ajuda. As Estrelas Espirituais querem falar como no Cume da Estrela Atiradora, em que ela teria mais força para cnversar melhor. Uma vez lá, Mário encontra muitas outras Estrelas Espirituais pedindo sua ajuda. Ele descobre que Bowser havia as aprisionado em cartões especiais e as deu para seus mais fortes seguidores. Mário Jorge estabelece, então, uma missão para ir em busca das Estrelas Espirituais. Mário Jorge faz muitos novos amigos e parceiros em sua longa e cansativa jornada e, eventualmente, recolhe todos as Sete Estrelas Espirituais. Mário Jorge retorna ao Cume da Estrela Atiradora, onde ele ganha acesso à Estrada da Estrela. Mário Jorge Samra Logan adquire uma nova habilidade chamada Estrela Boca e é transportado para o Castelo de Bowser no Santuário das Estrelas. Enquanto Mário Jorge e seu grupo estão no Castelo de Bowser, eles salvam os muitos prisioneiros e lutam contra Bowser no topo do castelo.
Usando suas táticas dissimuladas, Bowser impede todas as rotas de fuga e usa sua Estrela Rod para lutar. Mário e o grupo não conseguiam derrotar Bowser, enquanto ele estava usando a Estrela Rod, de modo que ao invés de usar a Estrela Boca para enfraquecer seu poder. Bowser continuametne não é afetado por ela e mexe com o raio de energia. Vendo a derrota de sua equipe, Peach pede ao povo do Reino do Cogumelo para ajudarem Mário Jorge e seus amigos para lutarem por suas vidas. Twink ajuda a transmitir esta mensagem na esperança através de seu pedido e de repente Mário acorda de seu estado de desmaio. Ele recupera toda a sua saúde, e descobre uma nova versão melhorada da Estrela Boca chamada Peach Boca. Mário e os outros, doces e prontos para irem em frente, enfrentam Bowser na segunda rodada. Mário atira a Boca Peach em Bowser, deixando-o indefeso e pronto para uma luta de igual para igual. Mário Jorge e os seus amigos derrotam o malvado Bowser e mais uma vez salvam o Reino do Cogumelo. O castelo retorna o terraço de onde veio e uma festa é realizada ali mais tarde. O poder da vontade é restaurado e mais uma vez o Reino do Cogumelo é salvo por Mário Jorge e seus amigos. Depois de um desfile liderado por Luigi, Mário leva Peach ao seu lugar de onde eles vêem as obras de fogo.
Mário e Peach estão dando um passeio fora do Castelo da Princesa Peach, quando um raio atinge o castelo. Mário rapidamente corre para verifica, enquanto Peach fica para trás, e é subitamente seqüestrada por Bowser Jr. O relâmpago no castelo era apenas uma distração para Mário. Mário adquire os Congumelos Mega Mushroom e o Mini Cogumelo. O primeiro permite que Mário crescer a um tamanho gigante, sendo capaz de esmagar todos os inimigos e obstáculos, como casas e edificios, enquanto o segundo permite que Mário encolha a um tamanho minúsculo, o que lhe dá acesso a novas áreas. Isto só é possível porque os Cogumelos tem poderes com a Força.
Mário primeiro enfrenta Bowser no primeiro dos oito castelos, onde Mário desligar um interruptor, fazendo com que Bowser caia na lava. No entanto, ele sobreviveu, como uma versão estrutural de si mesmo, conhecido como Bowser Seco. Uma luta é travada novamente no oitavo castelo, onde Bowser é encarado como Bowser Seco, mas é novamente derrotado. Mário finalmente chega ao castelo de Bowser, onde Peach foi tomada depois de Mário derrotar Bowser Seco. Aqui, Bowser Jr. lança os ossos de Bowser dentro de uma panela borbulhante, revivendo-o como uma versão um pouco maior do comum. No entanto, apesar de seu maior tamanho e força extra, Bowser ainda é derrotado quando Mário pressiona o interruptor, fazendo com que Bowser e seu filho caiam em um poço e libertando Peach.
Um ano depois, muitas coisas mudaram, Mário ainda volta para a sua própria casa. Mário foi pela primeira vez enfrentar Bowser que novamente capturou a Princesa Peach (O que virou rotina). Mário caminhou até o Esconderijo de Bowser (Castelo de Bowser), que está estranhamente localizado próxima ao reino do Cogumelo. Mário enfrenta Bowser em cima de uma nave e resgata Peach. Em seguida, uma enorme espada chamada Exor atingiu o castelo pela parte de cima e os lançou para várias partes do Reino do Cogumelo. Felizmente, Mário caiu próximo de sua casa.
Mário descobriu que os fragmentos da estrela que os foram roubados por um grupo chamado de Grupo Ferreira liderado por Ferreira. Esses criminosos tinham roubado não somente os fragmentos da estrela, mas tinham causado muitos problemas no Reino do Cogumelo. Nesta busca Mário foi acompanhado por Mallow, Peach, e até mesmo por Bowser. Eles viajaram por grande parte do Reino do Cogumelo em busca dos fragmentos da estrela protegidos por fortes membros do Grupo Ferreira. Depois de todos os fragmentos da estrela serem coletados, Mário teve que ir a sede do Grupo Ferreira e lutar com ele e o derrotar de uma vez por todas. Mário, é claro foi atrás dele no Castelo de Bowser na Terra da Rainha, que fiou inacessível quando Exor destruiu a ponte. Com a ajuda dos pais de Mallow, o Rei e a Rainha Nimbus, Mário conseguiu atravessar através de uma porte especial. Quando finalmente chegou lá, Mário derrotou Exor e foi para a dimensão de Ferreira pela boca de Exor.
A jornada de Mário por Ferreira foi dificil, pois este tinha soldados a sua disposição. Depois de muitas batalhas cansativas Mário enfrentou Ferreira, que foi inevitavelmente derrotado e, mais uma vez o Reino do Cogumelo foi salvo por Mário. Mário e Luigi foram novamente colocados em ação alguns dias depois. Mário e Luigi se sentam em sua casa um dia quando ouvem a notícia de que a Princesa Peach foi raptada. Eles vão para o Castelo de Bowser, pensando que ele raptou a princesa, mas não havia sido ele. Mais tarde, um inimigo novo e estranho chamado de Conde Klaus aparece e seqüestra Luigi e Bowser.
Mário vai para Flipside, uma estranha cidade no desertos. Mário encontra Bowser e mais tarde a Princesa Peach que decidem juntar-se com Mário em sua missão de parar o Conde Klaus. Mário deve novamente recuperar o fragmento de estrelas que estão em vários lugares. Mário também encontra novos inimigos, como O'Chunks e Dimentio, Brobot, Mimi, Anastácia e até mesmo seu irmão Luigi, agora chamado de Sr. L porque Anastácia, uma assistente do Conde Klaus fez uma lavagem cerebral nele (No entanto ele se juntou a Mário uma vez quando foi libertado por Dimentio e enviado para o Mundo Inferior da Força).
Depois de coletar os fragmentos da estrela, Mário, Princesa Peach, Bowser, Luigi e alguns Pixls confrontam o Conde Klaus. Após derrotarem o Conde Klaus, Dimentio, um velho servo de Klaus, volta e ele escapa para um lugar desconhecido para ser enfrentado mais tarde. Então Dimentio, junta os fragmentos da estrela e se funde com Luigi para formar o Super Dimentio. Depois de derrotarem Super Dimentio, Conde Klaus e Tippi se casam para parar os Espectros. Mário é mencionado para ser o primeiro dos Força-Destinados.
Um ano depois, um embaixador do Reino Feijão-Feijão veio para visitar a Princesa Peach. No entanto, ela era realmente um dos criminosos mais procurados do Reino Feijão-Feijão. Cackletta era um péssimo imitador que roubou a voz da Princesa Peach durante a sua visita. Os Toads vieram correndo para onde Mário e Luigi estavam os avisando sobre o dilema da voz da Princesa Peach. Assim Mário saiu do banheiro, e ele correu para o Castelo da Princesa Peach, levando Luigi com ele. Lá conheceram Bowser, adicionando mais de seus problemas. Mário lutou contra Bowser, mas Peach falou e interrompeu a luta. Enquanto ela falava, explosivos caíam de sua boca e isto sacudiu o castelo. Bowser, indignado que outro bandido roubou seu holofote, sugeriu que fossem para o Reino Feijão-Feijão com seu o Cruzador Koopa.
O aprendiz de Cackletta, Fawful causou uma falha no Cruzador Koopa fazendo Mário e Luigi aterrissarem nas fronteiras de Feijão-Feijão. Mário e Luigi foram para o Castelo Feijão-Feijão depois de resgatarem o Príncipe Peasley de sua horrível transformação. Depois de salvarem a Rainha Feijão, eles foram para o Porto Espacial Feijão-Feijão esperar a Princesa Peach. Limpando o aeroporto de alguns Plantas Piranhas, a nave de Peach pousou na pista. Mário Jorge, surpreso ao ver a Princesa Peach falando com sua voz normal, perguntou como ela teve sua voz de volta. Após a visita da princesa, a Princesa Peach queria ir para a Pequena Vilafungo. Durante a sua curta estadia, ela foi seqüestrada. No Castelo Feijão-Feijão, eles ouviram de Bowletta (O corpo de Cackletta possuido por Bowser), que os fragmentos da estela foram espalhadas após a segunda batalha com Popple e Rookie (Bowser como o homem Popple a e a sua segunda mão). Assim, Mário saiu para encontrar os quatro pedaços dispersos da estrela. Passando por uma longa viagem ao redor do Reino Feijão-Feijão, eles conseguiram obter todas os pedaços das estrelas. Depois disso, eles voltaram para o castelo, e Bowletta novamente enviou uma mensagem para entregar a estrela restaurada para o Coringa, com Peach em troca. Peasley deu a Mário e a Luigi 99.999.999 Moedas Cogumelos, que valem 99 Moedas Feijão-Feijão. Em seguida, Mário passou pelo Coringa para salvar Peach. Eles a salvaram usando um truque inteligente fazendo aparecer uma "Segunda" Peach, mas que na verdade era Luigi. Bowletta descobriu isso e de alguma forma o Cruzador Koopa se recuperou, mas Luigi conseguiu escapar.
No entanto, Bowletta também assumiu o Castelo de Bowser e atacou a Vila do Castelo Feijão-Feijão. Mário e Luigi pediram para Blanbladon levá-los para a fortaleza voadora no céu. Depois de derrotarem os Koopalingos e muitos inimigos fortes, chegaram à sala do trono. Quando eles derrotaram Bowletta ela os engoliu para dentro de seu corpo, onde eles tiveram que lutar lá contra o Espírito de Cackletta. Mário e Luigi finalmente vencem o Espírito de Cackletta. Eles escaparam do castelo (Que foi criado para explodir) a tempo de salvar o Reino Feijão-Feijão.
Mário também teve que lutar contra os Shroobos que invadiram o seu mundo natal e tomaram a Vila Toad e o Castelo da Princesa Peach, eles invadiram e transformaram alguns Toads em servos deles para pegar o vim deles, um importante produto comercial para recuperarem a glória. Os Shroobos liderados pelas Princesas Shroobos Velha e Nova respectivamente raptaram a Princesa Peach e colocam na Estrela Cobalto. No final, esta estrela é despedaçada. Mais fortes que os Soldados Koopas, os Shroobos vieram de Shroob. Com a ajuda de seu irmão Luigi, Mário consegue vencer novamente com a ajuda do Professor E. Gadd que constrói um lançador de água do Vale das Lágrimas que é a fraqueza dos Shroobos e acabando definitivamente com a ameaça alienígena. Mário também confronta e vence as Princesas Shroobos.
Mário também teve que lutar contra os Shroobos que invadiram o seu mundo natal e tomaram a Vila Toad e o Castelo da Princesa Peach, eles invadiram e transformaram alguns Toads em servos deles para pegar o vim deles, um importante produto comercial para recuperarem a glória. Os Shroobos liderados pelas Princesas Shroobos Velha e Nova respectivamente raptaram a Princesa Peach e colocam na Estrela Cobalto. No final, esta estrela é despedaçada. Mais fortes que os Soldados Koopas, os Shroobos vieram de Shroob. Com a ajuda de seu irmão Luigi, Mário consegue vencer novamente com a ajuda do Professor E. Gadd que constrói um lançador de água do Vale das Lágrimas que é a fraqueza dos Shroobos e acabando definitivamente com a ameaça alienígena. Mário também confronta e vence as Princesas Shroobos.
Mário é convidado para o Festival da Estrela por Peach, mas seu castelo inteiro é abduzido por Bowser durante o festival, e Mário Jorge é lançado para o espaço exterior, como parte de seu plano para criar um Império no centro da Galáxia de Orião, com Peach ao seu lado. Ao se recuperar no Portal Galáctico, Mário Jorge é convidado por Rosalina para resgatar as Estrelas de Energia, para salvar Peach. É dado a Mário Jorge a Bêbe Luma, que permite que ele siga as tais estrelas e viaje com ele para todos os lugares. Ao longo do percurso, Mário Jorge também recebe cartas de Peach, que o envia Cogumelos da Força atráves delas.
Depois de vários encontros com Bowser, Mário Jorge o derrota no Reator da Galáxia de Bowser. No entanto, a única coisa que lutaram um contra o outro no Reator que explodiu na estrela; quando explodiu desencadeou uma reação em cadeia, e não havia nada para manter o sol intacto, e se tornou supernova, explodindo e criando um buraco negro. No entanto, antes de Mário Jorge ser sugado, ele é visto em um estado de choque quando o Bebê Luma se sacrifica para impedir o buraco negro de Bowser de consumir tudo ao seu redor, incluindo Mário Jorge e o Castelo da Princesa Peach. Depois de uma grande explosão, Mário acorda nas terras do Castelo do Reino do Cogumelo, e Rosalina o agradece por ter salvado a Galáxa de Orião mais uma vez.
Uma nova doença, os Blorbs, fazem os Toads crescer a um tamanho gigante, Fawful tem afetado os cidadãos do Reino do Cogumelo, vendendo os Cogumelos Blorb. Mário Jorge e Luigi participam de um encontro e são interrompidos quando o Cruzador de Bowser adentra e então luta contra Mário Jorge. Depois de derrotado, Bowser recebe um Cogumelo Vácuo de Fawful. O cogumelo faz que Bowser inale tudo, incluindo Mário Jorge, Luigi, Starlow, e a Princesa.
Mário Jorge e Luigi são encontrados dentro de Bowser, que é atingido em Cabo Cavi. Os Irmãos Samara Logan e Starlow ajudam Bowser a obter o seu castelo de volta de Fawful. Ao longo do caminho, Bowser encontra Broque e Broggy e obtém a capacidade do Bloco de Vácuo. Mário Jorge, Luigi e Starlow ajudam Bowser em suas viagens, enquanto eles viajam para várias partes de seu corpo. Quando Bowser finalmente chega a seu castelo e o recupera, Bowser cultiva gordura ao vencer a luta contra Midbus, um porco gigante.
Enquanto Bowser estáa gordo, Mário Jorge e Luigi encontram Peach, na Zona Flab, que é sequestrada na frente deles por Alfa Kretin. Depois de uma paassarem por uma armadilha de caça, Mário e Luigi armam e derrotam Alfa e Beta Kretin, libertando a princesa. Peach, após a batalha contra o Chefe, diz que Fawful provavelmente quer a Estrela Negra, para que ele possa controlar o Reino do Cogumelo. Ela também explica que Peach é necessária para este processo. Como encontram uma saída, Peach é retirada do corpo de Bowser por Fawful e é mais uma vez raptada. Enquanto isso, Bowser recebe uma esteira para perder os quilos extras por Midbus, um porco.
Mário e Luigi vão para se encontrarem com Bowser derrotado em uma ilha de sucatas. Depois de lutar contra Aterro, eles voltam para dentro de Bowser, que acorda com uma doar nas costas. Depois de passar por todo o castelo para encontrar e despertar a Estrela Negra e Fawful se tornando o Fawful Negro, que é arremessado por Bowser. Estrela Negra entra em Bowser, que copia o seu DNA, mas graças os Irmãos Samara Logan o imcompletam, e combina com Fawful Negro para criar o Bowser Negro.
Depois de Mário Jorge e Luigi derrota Núcleo da Estrela Negra e Bowser derrota o Bowser Negro, Fawful explode, derrotando a si mesmo, e expulsando todos os outros do corpo de Bowser, libertando-os. Depois de perceber que Mário estavam dentro de Bowser, Bowser luta contra Mário Jorge e Luigi, que terminam com a história. E derrotam Bowser novamente e volta para o seu castelo, agora em ruínas.
Em uma parte de sua história, Mário vai para Sarasalândia, e lá ele vai para cada um dos quatro regiões daquele lugar, incluindo a Ilha dos Moais, o Grove Oriental, um reino mitico de Mú, e até em construções Zaioonianas datadas do Novo Império Zaiooniano, os Zaioonianos provavelmente abadonaram o local com o fim do Novo Império para um líder Zaioooniano tentar raptar a Princesa Margarida uma prima de Peach. Na Ilha dos Moais, Mário luta contra as construções e descobre que são criaturas vivas. Finalmentte Mário derrota o líder Zaiooniano usando sua conexão com a Força e salva Margarida.
Ao voltar para casa, Mário e Luigi descobriram que seu tio e tia foram mortos pelas tropas do Terceiro Império Galáctico à procura de R2-D2 e C-3PO. Com a sua família morta, Mário e Luigi concordaram em acompanhar Liana para Valdenda para enviarem o dróide astromecânico, contendo planos do Núcleo de Fantomile, a Elrond, a pedido de sua filha, a Princesa Élfica Sara Liliana. Os três foram para o Reino do Cogumelo para embarcarem para o Sistema Valdenda, e na Cantina Toad encontraram Han Solo, um contrabandista de Coréllia e seu co-piloto Lumpy. Uns criminosos incluindo Ponda Baba tentam intimidar Mário e Luigi, mas são vencidos por Liana.
Depois de escaparem das tropas de assalto do Terceiro Império e saírem do planeta na nave de Solo, a Último Milênio-Luz, May começou a treinar Mário e seu irmão Luigi nos caminhos da Força, principalmente no manejo do Sabre-de-Luz, apesar de apenas ser tudo brincadeira. No entanto, o treinamento foi interrompido logo ao chegarem ao Sistema Valdenda e descobrem que o planeta tinha sido destruído. Em seguida, avistaram vários Caças Estrelares, e ele via que todos estavam se aproximando do que aparentava ser uma pequena Lua. Para sua surpresa, acabou por ser o próprio Núcleo de Fantomile. Preso por seu raio trator, foi levando a bordo da gigantesca estação espacial.
Uma vez a bordo do Núcleo de Fantomile, May partiu com Samara, Solo, Chewbacca e os dróides para desativarem o raio trator. Mas quando ele descobriu através de R2-D2 que Sara Liliana também estava presa ali, Skywalker insistiu para irem resgatá-la. Com a ajuda de Solo e de Chewbacca, o trio conseguiu infiltrar-se na área de detenção, sob o pretexto de Soldados escoltando um prisioneiro Wookiee. Conseguiram atingir a cela de Sara, mas uma vez juntos, eles tinham que descer através de um depósito de lixo, para escapar da perseguição das forças do Terceiro Império. Graças à ajuda no último segundo de D2 R2, saíram do triturador, Mário e Sara foram separados de Han e Lumpy, mas depois de um beijo de boa sorte de Sara e balançando em um canal profundo, conseguiu iludirem as Fantomtropas se encontrando novamente com os dois contrabandistas no hangar principal onde estava a nave deles. Finalmente, o grupo inteiro, exceto Liana May Xiang, escapou do Núcleo de Fantomile, graças ao sacrifício de Liana em seu duelo final com Darth Mama. O resto foi em direção a Lua de Miranda com o Núcleo de Fantomile seguindo eles. Foi só então que receberam a sua recompensa pelo resgate de Sara e começaram os preparativos para sair.
Foi na base da Lua de Miranda, onde Samara pela primeira vez se tornava um membro oficial da República de Maria Isabel Samara. Passando muito tempo em simuladores de vôo, mostrando sua habilidade como piloto perante aos líderes da Revolução. Em várias dessas simulações, ele enfrentou toda uma frota estrelar. Apenas retirado duas vezes. Depois de inspecionar os resultados do simulador de Samara, o Líder Azul Garven Dreis se aproximou de Mário com Vanden Willard, para lhe dizer como ficaram impressionados com as suas habilidades. Dreis o recebeu como um membro do Esquadrão Vermelho, e deu a sua própria esquadra de Caças XT-MiG chamada de Azul Cinco.
Pouco antes de subir em seu MiG, Samara teve a grata surpresa de encontrar seu velho amigo Nugget Bigfats. Ambos voaram novamente como nos velhos tempos para a próxima batalha. Após uma breve conversa, Dreis assegurou Samara de ter Nugget Bigfats como piloto, e disse a Mário sobre as muitas histórias que ele queria dizer a ele depois da batalha.
Samara lutou na Batalha do Monumento Central com o Vermelho Cinco ali e presenciou a morte de muitos de seus amigos, incluindo Bigfats, e depois da morte dos principais líderes, assumiu o comando do ataque final. Com apenas o surgimento a tempo do Último Milênio-Luz e a orientação do Espírito de Liana, Samara disparou um único tiro e usou a Força para direcionar o foco de seu torpedo de prótons em direção a sua meta de destruir a estação. Com esta ação, ele e Han Solo foram agraciados com a Estrela de Valdenda.
Após a destruição do Núcleo de Fantomile, ele liderou uma série de missões para República de Maria Isabel Samara. Duas semanas depois da Batalha do Monumento Central, Samara já tinha participado da destruição do Aeróstato Estrelar do Terceiro Império Classe-Administrador I, ele ajudou a República de Maria Isabel Samara a equipar-se com os novos Alas-X coletados diretamente de Vors Voorhorian, (Onde ele mostrou seu extraordinário potencial para derrubar os Caças FA-TIE do Terceiro Império usando apenas o Sabre-de-Luz de sua mãe), lutando na Batalha de Vactooinee, e viajou até Bonadan e para as Regiões Desconhecidas. Ele foi enviado para investigar os novos locais das bases de Akura II, Drexel e Guardião do Mundo. Tudo terminou em violência e fracasso.
Rei Boo enganou Luigi para esse pensar que ele tinha ganhado uma mansão e foi capaz de interceptar Mário em um corredor. Mário foi posteriormente resgatado por Luigi e foi libertado de sua prisão. Mário foi passar as suas férias com Peach e o Chefe Toad na Ilha Golfinho no Grande Mar de Olrox. Na Ilha Golfinho são recebidos bem pelas espécies nativas locais, os Piantas, aqui Mario foi preso com uma falsa acusação contra ele. Aparentemente, um imitador de Mário chamado Mário Sombrio tinha espalhad o caos por toda a ilha tropical usando uma espécie de alienígena negro e gosmento, o Goop. Confuso, Mario teve uma audiência de defesa de seu chamado "Crime". Usando uma pequena bomba de água portátil chamada F.L.U.Í.D.O., Mario tinha que limpar toda a ilha dos Goop e devolver pedras douradas de volta para o lugar. Durante esta aventura, Mario também salvou muitas sub-espécies de Yoshi da Ilha Golfinho. Mário começou a limpar a ilha e descobriu quem era seu sósia. Era Bowser Jr., filho caçula de Bowser, querendo vingança.
Mário Sombrio logo capturou Peach, levando-a para a Ilha Pinna. De lá, Mário usa um canhão no Hotel Golfinho para ir atrás dela, e, após a perseguição por Mário Sombrio pelo parque de águas termais, ele chega a um lago, onde Bowser Jr revela-se como Mário Sombrio e contruiu um enorme dróide com o formato de Bowser. No entanto, ele derrota o robô usando F.L.U.Í.D.O. Mário também descobriu que Bowser Jr. tinha plantado o graffiti no lugar de Mário Sombrio para que Mário fosse enviado para a prisão, mas ele falhou. Bowser Jr., em seguida, reentrou na cabeça do robô, que separada do robô, setranformou em uma nave espacial e eles voaram para a Montanha Corona.
Depois que Mário chegou ao topo da montanha, onde Peach e Bowser Jr. estamam sentados em uma banheira de água quente. A interrupção enfurece Bowser Jr., e ele começa a lutar contra Mário. No entanto, apesar de ter a ajuda de outros Koopas, que estavam atirando Balas Bills de suas naves, Mário ainda consegue chegar em Bowser Jr. E em todas as cinco seções da banheira de água quente, fazendo-a virar, mas todos Mário, Peach, e Bowser Jr. Caem no chão. Mário e Peach vão para terreno a oeste da ilha no Hotel Golfinho, onde Mário também encontra F.L.U.Í.D.O. deitado no chão, altamente danificado com a queda e o estresse da batalha. F.L.U.Í.D.O. então pergunta se ele tivesse realmente tivesse visto Mário antes de desligar. Os dois então veem como as pedras douradas brilham na ilha e restauram a luz da ilha. Mario, em seguida, conseguiu finalmente aproveitar suas férias com Peach e os outros.
Certa noite, Mário tem um sonho com um local chamado Subcon que era uma terra de fadas. Contam a históriado malvado Rei Wart que dominou as terras de Subcon e que precisavam da ajuda de Mário para derrotarem Wart. No entanto, após o despertar de seu sonho, Mário simplesmente gostou do sonho e voltou a dormir. No dia seguinte, Mário, juntamente com seus bons amigos Luigi, Princesa Peach e Toad decidem em um piquenique. No entanto, ao procurar um lugar apropriado, Mário e seus amigos notam uma estranha caverna e decide explorá-la. Depois de entrar na caverna, os quatro amigos são transportados para a terra de Subcon. Com a memória que tinha do seu sonho, Mário decide salvar Subcon de Wart, e convida seus três outros amigos para ajudá-lo em sua jornada. Ao longo da sua aventura, Mário e seus amigos derrubar muitos membros do exército de Wart (Incluindo seus líderes que servem como Mestres, como Birdo e Mouser). Eventualmente, Mário e seus três amigos chegam em Wart e o derrotam. Depois de derrotar Wart, Mário e seus amigos resgatam as fadas em Subcon e, finalmente, resgatar toda a terra do Subcon. Em contraste com os outros personagens, Mário é um personagem bem equilibrado sem habilidades especiais. Depois é explicado que Subcon é realmente um mundo de sonhos.
Mário também teve que encontra os seus irmõasseguindo as vezes de Liana May, ele finalmente os encontrou um por um. Mileena Nayame em uma aventura para combaterem Darth Mama, Samus Aramovich em sua casa num dos centros da República de Maria Isabel Samara, Jeffrey em uma caminhada fora de seu mundo natal. Ash Ketchun em uma viagem com Pikachu, Artur Link após recuperar a Espada Mestra em Hyrule. Artur Link veio para perseguir o Rei dos Gerudos Ganondorf que tinha se juntado a José Cesar Fobos para liderar um ataque Orc a Hyrule. Inicialmente Link, Mário, Luigi lutaram entre eles mesmos, e depois com o Terceiro Império, eles aprenderam a se reconciliarem após algum tempo. Eles também encontraram Mega-Homem perdido no antigo laboratório de Tomé Luz adormecido. E depois que ele acordou se juntou aos irmãos e amigos para lutar contra o Terceiro Império. Mas o Imperador também tinha lacaios, Sigma, Ganon e Ridley eram os principais e mais poderoso servos de Fobos além de Darth Mama.
Seis meses após a Batalha do Monumento Central, Mário, Luigi, Han e Lumpy foram enviados para investigar as atividades do pirata Marca de Sangue perto de uma rota de abastecimento dos Revolucionários, mas Mário e Luigi estavam indecisos e inseguros sobre o papel deles no final da República de Maria Isabel Samara. Durante a missão, Mário e os outros se encontraram com um grupo de soldados de assalto desertores que estavam com eles em sua nave e depois dos soldados desertores os ajudou a vencer o ataque dos piratas. Na primeira, os soldados se colocaram como investigadores da União dos Transportes, enquanto os Revolucionários pariam serem ajudantes independentes, mas logo se descobriu as suas identidades falsas, e nenhum dos dois lados totalmente confiava um no outro, mas Mário conseguiu colocar de lado seus medos e impedir que eles se dividissem. Então descobriram que Sara Liliana tinha sido capturada em Shelkonwa e procurou modos de ajudar, enquanto a Mão do Juízo acreditava que havia uma conexão entre o governador de Shelkonwa e os piratas. Os quatro Revolucionários, com a ajuda dos soldados renegados, conseguiram infiltrar-se no Cidade Makrina e resgatar Sara, e fugiu de volta para a República de Maria Isabel Samara, apesar da grande presença Imperial, incluindo Darth Mama.
Peach pediu para Mario vir para uma terra chamada Vila do Porto distante do Reino do Cogumelo. Ela encontrou um mapa do tesouro levando a poderosos artefatos chamados de Estrelas de Cristal. No momento em que ele chegou lá, Peach tinha sido seqüestrada por um grupo conhecido como Sociedade Secreta dos X-Nauts. Eles pretendiam usá-la como uma posse da Rainha Sombria para que o líder do X-Nauts, Sir Grodus pudesse usar seu poder para ajudá-lo na dominação de Olrox. Mário encontrou um Goomba inteligente chamado Professor Frankly. Ele contou a história da Vila do Porto para Mário e revelou o segredo da Porta de mil anos.
A Rainha Sombria uma vez no passando assumiu o controle da Vila do Porto, escravizando e matando muitos de seus cidadãos. Para conseguir isso, ela criou as estrelas de cristal e as usou para fornecer um grande poder. Os quatro heróis lendários usaram o poder das estrelas de cristal contra ela e ela foi presa na Portal dos Mil Anos por um milênio. Mario começou a coletar todas as sete estrelas de cristal. Ganhando muitos novos parceiros e encontra ndo todas as estrelas de cristal, Mario atravessou a Porta de Mil Anos. Lá ele encontrou Sir Grodus diante da sala da Rainha Sombria. Mário derrotou Sir Grodus, mas foi depois emboscado por Bowser Jr. e Kammy. Isso deu tempo de Grodus escapar com Peach para a sala da Rainha Sombria. Quando Mario chegou lá, Grodus havia despertado a própria Rainha Sombria, assumindo o controle do corpo de Peach. Mario teve que lutar contra ela na forma possu ída e com a ajuda de desejos dos cidadãos da Vila do Porto, Mário prevaleceu.
Ansioso para servir a República de Maria Isabel Samara, os primeiros anos de Samara Logan foram cheios de aventura lutando contra piratas, enquanto ajudava na batalha contra as forças do Terceiro Império e evitando cair nas garras de Darth Mama e seus agentes. Durante uma missão de reconhecimento, a nave de Samara Logan foi capturado pela atração de um cometa transdimensional, que o levou para o mundo gelado desolado de Hoth. Samara Logan voltou para a República de Maria Isabel Samara e informou aos seus superiores do mundo isolado. A República de Maria Isabel Samara planejou evacuar os seus assentamentos na Lua de Miranda e em Thila para estabelecer uma nova base em Hoth.
Durante a evacuação de Miranda, Samara Logan chegou ser Comandante nomeado por João Chevrolete, mas a sua promoção não foi concluída pela captura do General. Ainda assim, depois de alguns dias após a evacuação da base, Samara Logan tornou-se Vice-Comandante e liderou missões em Olrox, Ralltiir e Tatooine.
Quando Samara Logan se sentia verdadeiramente em casa era quando estava no esquadrão de caças. Quando não está voando com o Esquadrão Vermelho e seu velho Comandante Narra, era levando a equipe recém-nascido de ataque do Esquadrão Asa Valente para mundos como Barklesh, Chorax, Coréllia e Gerrard V.
Antes do fim do ano, Samara Logan se viu envolvido em missões fora da cabine de um Caça Estrelar. Ele participou de ações de combate em Jabiim, Kalist VI, Kiva e Lupelo e descobriu em primeira-mão os horrores da guerra. Em Kalist VI, Mário em Luigi tiveram um encontro inesperado com o amigo de infância deles Janek Sunbed, agora um Tenente Cara-Pálida do Exército do Terceiro Império, que terminou com a quase destruição da Frota Revolucionária.
Em 2 anos DBMC, ele e Luigi acompanharam a Princesa Sara Liliana em uma missão diplomática no Sistema Circarpous onde foram parar no planeta Mimban. Ali Mário, Luigi e Sara encontraram uma velha sensitiva a Força chamada Halla. Eles fizeram um acordo com ela, prometendo encontrar o Cristal Kaiburr se ela prometesse ajudá-los a deixar o planeta. No entanto, Darth Mama também estava à procura do poderoso cristal. Com ambos os lados procurando a poderosa relíquia da Força, Mama e Samara Logan travaram um duelo no antigo Templo de Pomojema. Cada movimento de Samara Logan foi guiado pelo espírito de Liana e com a potência extra do cristal e de seu irmão Luigi, o homem conseguiu surpreendentemente desafiar Mama, ainda que conseguisse cortar o seu braço mecânico. Chocada, Mama caiu em um poço profundo terminando assim o duelo.
Transferido para a Base Eco com o Esquadrão Asa Valente, em 3 anos DBMC, Samara Logan patrulhava regularmente o frio perímetro da base. Em um reconhecimento nos arredores, foi atingido por um Wampa. Ele recuperou a sua consciência na caverna do predador, ele cortou um braço da criatura e escapou apenas para ficar no frio extremo e muito longe da base. Depois de uma longa caminhada com ventos fortes, caiu exausto. Próximo a morte, ele teve uma visão de Liana May Xiang, que disse a ele para procurar os ensinamentos de Yoda no Sistema Dagobah, e foi então resgatado por Han Solo.
Samara Logan se recuperou de seus ferimentos, com cortes profundos e um osso da face esmagado em um Tanque Bacta, mas não tinha muito tempo para se recuperar, uma dos milhares de FA-APU enviadas por Darth Mama, que estavam espalhadas por toda a Galáxia de Orião em busca do Jedi e a base nova da República de Maria Isabel Samara desceu em Hoth e as provas da atividade Revolucionária enviadas ao Terceiro Império Galáctico. Na subseqüente batalha, Samara Logan liderou seu esquadrão, tentando atrasar o ataque e dar mais tempo para a evacuação. Sob sua liderança, o Aeroplanador demonstrou a sua eficácia no ataque em massa aos FA-MTT mais que o Terceiro Império esperava. Além disso, mesmo depois de ser derrubado, Mário mostrou o seu enorme potencial como um Jedi, quando sem nenhuma ajuda destruiu um dos andadores com eficácia espetacular. Enquanto as forças do Terceiro Império acabaram com as defesas, o último transporte Revolucionário partiu levando Mário Jorge e seu irmão Luigi em seu Caça MiG.
Em seguida, Mário e Luigi foram para Dagobah, onde se encontraram com Yoda. Em seu primeiro encontro, Mário e Luigi estavam suspresos e confusos com o ambiente e o diminutivo Yoda, que inicialmente não se identificou como tal. Mais tarde, o seu apreço pelo bichinho mudou quando soube quem ele era. Apesar de Yoda concordar em treinar Mário e Luigi com a insistência do espírito de Xiang, o treinamento dos irmãos Samara Logan se tornou difícil, pois seu passado aventureiro tinha transformado a sua mente em ação e emoção. Quando Yoda pediu a ele para entrar na caverna que era supostamente encontrar apenas o que os irmãos carregavam com eles, foi testado por uma visão de si mesmo vestindo a armadura de Darth Mama. Logo depois, teve uma visão de Han Solo e a Princesa Sara Liliana sofrimento em Cidade do Infinito na Cúpula Meridiana. Apesar dos avisos e da desaprovação de Yoda e de Liana May, os irmãos Samara deixaram Dagobah rapidamente para ir resgatá-los.
Os irmãos Samara Logan chegaram à Cidade do Infinito e com o Blaster nas mãos, indo resgatar os seus amigos. Foi quando Gustavo Haddad atirou neles e em seguida, se viram em uma emboscada das Tropas de Assalto e oficiais do Terceiro Império. Naquele momento ele viu que Sara estava sendo usada como escudo Humano por um agente do Terceiro Império. Embora tendo ela, Sara tentou avisá-lo que tudo era uma armadilha. Tentando ir em frente foram levados para a câmara de Congelamento de Carbono, onde Mama os estava esperando. Os três estavam lutando em um feroz duelo. Mama mostrou-se superior no tratamento personalizado na Forma V do Sabre-de-Luz, executando o Mai Cho e Dun Mönch. Mama tentou seduzir o fraco de Mário e de Luigi para o Lado Negro da Força. Ao final da disputa, quando Mama, em um movimento, imediatamente decepou a mão de cada um deles. Tentando convencer seus filhos, Mama disse que ela era a mãe deles e pediu a eles para acompanhá-la e governar a Galáxia de Orião como mãe e filhos. Diante de tal revelação horrível, e até mesmo a tentação ainda mais temível de se unirem a Mama, Mário e Luigi encontraram a coragem e preferiam a morte a tudo isso, e decidiram dar um salto no vácuo em direção um profundo poço. Felizmente, eles sobreviveram, mas ficaram presos lá no fundo. Sem força e sem ajuda, Mário contatou Sara pela Força e, em seguida, a Última Milênio-Luz, e voltaram para o resgatá-los com Lando Calrissiane, Lumpy, Sara e os dróides a bordo. Após o encontro com a Frota Revolucionária, Samara Logan adquiriu a sua mão cibernética a bordo da Redenção.
Logo após a Batalha de Hoth, Samara Logan foi enviado como membro da delegação diplomática para Abridon. Sem dúvida, devido ao seu heroísmo como um Cavaleiro Jedi da Revolução, Samara Logan era uma das cinco personalidades enviadas para convencer o Conselho de Governadores de Abridon para se juntarem à República de Maria Isabel Samara, após sua revolução contra o Terceiro Império. No entanto, a liberdade de Abridon não durou muito. O Grande General Cara-Pálida Malcor Brashin e o General Cara-Pálida Brenn Tantor chegaram dentro dos dias e esmagaram a Revolução. Hamman Flatt, líder dos Nacionalistas de Abridon, vendeu os diplomatas Revolucionários tentando salvar sua vida, Samara Logan, juntamente com o restante da delegação, foi perseguido e capturado por Tantor.
De Abridon, Samara Logan foi enviado para a Prisão Kalaan, onde esperava para ser transferido para Coruscante. Felizmente, ele foi resgatado por seu próprio captor, Tantor, que logo após a captura de Samara Logan, tinha se recusado a obedecer a ordem para a matança de alguns civis, mas também foi preso em Kaala. No entanto, ao contrario de Samara Logan, Tantor tinha apenas uma unidade de Replóides para intervir. Seus Replóides o soltaram e ele desertou para se juntar ao General Revolucionário Tyr Taskeen, levando Samara Logan com ele para provar suas boas intenções.
As conseqüências da Batalha de Hoth espalharam a República de Maria Isabel Samara, Samara Logan mudou-se para as temporárias bases de Golrath e de Arbra, de onde continuaram a realizar missões para a República de Maria Isabel Samara. Em uma dessas missões, durante a transferência para uma nave do Terceiro Império à deriva vagando próxima á Golrath, Mário encontrou toda a tripulação morta. Suspeitando de uma pedra estranha vermelha que brilhava, como a origem das mortes misteriosas, Mário voltou a Golrath rapidamente, mas então ele foi atingido por uma doença misteriosa. Logo ele estava em coma, com os olhos ardendo. De fato, a condição de Mário estava associada à pedra vermelha. Esta doença era conhecida como o Sono Eterno, e é produzido quando duas pedras da Nebulosa Vermelha são separadas. Luigi e Sara chamaram Lando e Lumpy de volta para suspenderem temporariamente a busca por Han e, juntos, eles embarcaram em uma jornada na Última Milêno-Luz para encontrar as outras pedras e salvarem Mário. De fato, a infecção de Mário pela Pedra Eterna tinha sido uma armadilha armada por Domina Tagge tentando matar Mário e vingar o irmão morto, cuja morte, foi causada por Darth Mama que acusou Mário falsamente. Domina preparou a armadilha para Mário depois de receber as pedras de um Caçador de Recompensas contratado, em seguida, soldados do Terceiro Império subiram em sua nave. Depois de convencê-los que eles viriam para Golrath para capturar Mário, Domina colocou um frasco com uma das pedras a bordo da nave do Terceiro Império, e sendo aberta pela pressão da viagem através do hiperespaço, em sua chegada a Golrath a tripulação do Terceiro Império foi morta, deixando a nave à deriva pronta para a infecção de Mário. Enquanto Luigi, Lando e Sara foram capturados pelo Caçador de Recompensas de Domina, um dos prisioneiros conseguiu a segunda pedra na nave da Tagge. Domina e alguns de seus seguidores conseguiram se refugiar em uma câmara fechada, mas foram capturados. Então, Luigi, Lando e Sara aproveitaram a oportunidade para libertar-se e foram apanhados pela Última Milênio-Luz. A partir daí, fizeram um acordo com Domina, que ele oferecesse a segunda pedra por uma nave para escapar. Tagge concordou, e Sara, Luigi e Lando levaram a segunda pedra de volta para Golrath, onde os cristais foram juntados e Mário foi curado. Após sua recuperação, eles carregaram os cristais da nave do Terceiro Império abandonada e os enviaram para a estrela Golrath. Mário continuou a servir a República de Maria Isabel Samara como tinha feito antes.
Quando a República de Maria Isabel Samara descobriu a Superarma Bowser, enviou um pequeno comando constituído por Mário, Luigi, Samus Aramovich Samara Logan, Mega-Homem, Lumpy, R2-D2 e C-3PO para pousarem como trabalhadores e infiltrar-se na estação de batalha. A Milênio-Luz foi para Hockaleg—O local de Bowser—Os Revolucionários planejavam usar granadas de prótons para destruir o reator da superarma. Infelizmente, Mama estava a bordo da estação, ela sentiu a presença de Mário e de seus outros filhos e preparou uma armadilha para proteger o reator e capturar o Jedi.
Apenas escaparam graças aos soldados do Terceiro Império que tentaram ameaçar a vida de Mama. Fugindo da Sith, Mário e os outros abortaram a missão e partiram em uma nave. Eles foram perseguidos proximamente por alguns Caças FA-TIE do Terceiro Império, mas Lando, que tinha se escondido na Milênio-Luz fora da nave de Hockaleg desintegrou os Caças. A equipe Revolucionária embarcou na Milênio-Luz e se preparavam para irem embora, mas Mama, que haviam sobrevivido à tentativa de assassinato, seguiu em seu jogo pessoal. Para escapar dela, Mário lançou o fornecimento de água para o espaço, que congelou no local. Mama se chocou no muro de gelo, o que finalizou a sua ameaça, mas depois, o Terceiro Império disparou a arma principal Bowser contra eles, no entanto, Sara tinha sabotado, então ao invés de destruir os Revolucionários, destruiu a si mesma.
Para se preparar para uma nova missão da República de Maria Isabel Samara, Mário, Luigi, Lando e Lumpy foram enviados para recolher quatro Caças FA-TIE. Eles se encontraram com o seu contacto, Orião Ferret em Bazarre, e recebeu uma nave e coordenadas para o mundo desenvolvido de Patch 4, onde os Caças estavam esperando. Na chegada, eles os encontraram, mas foram atacados por Bestas Vigilantes que, sem o conhecimento de Mário, eram controladas por Ferret. Mário, Luigi e Lando fugiram para as cavernas nas proximidades, onde encontraram uma comunidade de indivíduos habitando seu interior. Graças ao sopro de Serja Kesselrook, uma das habitantes da caverna, Mário e Luigi fugiram para a nave em que chegaram, enquanto Lando distraía a fera. Uma vez a bordo da nave, Mário e Luigi dispararam o Tranqüilizante Sônico para controlar os animais, fazendo-as dormir. Então, eles poderiam recuperar os Caças, a Última Milênio-Luz e Lumpy, e voltaram para Arbra.
Em sua chegada ao comando do Esquadrão Asa Valente, Samara Logan se apaixonou por uma colega de equipe, a talentosa e a enigmática Shira Brie. Durante uma batalha árdua contra o Terceiro Império, a aparelhagem do computador de bordo de Mário foi desativada e ao invés disso, usou a Força para atingir os seus objetivos. Inexplicavelmente a Força disse-lhe para abrir fogo contra uma nave amigável, e de repente atingiu Shira Bire. Devido a isso, Samara Logan foi rebaixado ao controle remoto e levado a julgamento. No início, a sua confiança na Força foi reorganizada, mas investigou a fundo o assunto e descobriu que Shira, na verdade, era uma agente do Terceiro Império. Samara Logan limpou o seu nome e foi reintegrado como um Comandante Revolucionário.
Com o tempo, Samara Logan se tornou mais poderoso na Força, e suas façanhas na Reública de Maria Isabel Samara aumentaram sua reputação. Ele descobriu de Gustavo Haddad, que estava com o bloco congelado de Han Solo estava próximo a Gall. Mário, Luigi e as Asas Valentes voaram para seguirem Mário e Sara na Última Milênio-Luz. No entanto, seu ataque foi bem sucedido e seu guia Dash Rendar abandonou Gustavo e fugiu. Na viagem de volta, o Dróide Astromecânico de Wes Janson entrou em mau funcionamento, assumiu controle do Caça Estrelar e apontou para a nave de Mário e Luigi. Samara Logan conseguiu desligá-lo, sem causar qualquer dano a Janson. Na chegada à base, foi descoberto que tinha sido sabotado por um mecânico.
De volta à Olrox, Mário e Luigi passaram muito tempo na antiga casa de Liana May Xiang, onde construíram um novo Sabre-de-Luz verde com a ajuda de um manual preparado por Liana, baseado no desenho de seu antigo Sabre. Depois de desviar um ataque de um Grupo em Motos Rápidas, com a ajuda de Dash Rendar, que havia sido contratado para cuidar dos irmãos Samara Logan. Mário e Luigi encontraram uma mensagem dróide projetado para Sara, que tinha ido se encontrar com representantes do Sol Negro. Mário e Luigi conseguiram a senha para acessar a mensagem. Ela tinha sido enviada por Koth Melan, um Mestre espião Bothano. Mário e Luigi foram ao encontro dele com Dash Rendar. Dash e Luigi com a ajuda de Mário queriam atacar o Cargueiro Suprosa, que estava transportando informações confidenciais do Terceiro Império. Mário e Luigi treinaram os pilotos MiG do Esquadrão Bothano e liderou o ataque. Apesar de terem sofrido pesadas perdas, a informação foi obtida, e Dash Rendar saiu novamente depois de não conseguir evitar a morte de vários pilotos Bothanos. De volta à Base Bothana sofreu um ataque. Embora os dados fossem transferidos com segurança para a tradução, Mário e Luigi foram capturados por um Caçador de Recompensas Barabel. Conseguindo escapar de outro ataque, Lumpy entrou em contato com ele e informou-o que Sara Liliana estava nas mãos da Rainha do Sol Negro, a Rainha Maria, que estava por trás de todas as tentativas de assassinatos de Mário Luigi para desacreditar Darth Mama em sua luta contra a Lady Negra para alcançar o poder. Mário e Luigi se encontraram com Lando e Lumpy e entraram no Centro do Terceiro Império. Depois de se encontrar novamente com Dash Rendar. Mário conseguiu infiltrar-se do Palácio de Maria entrando pelos esgotos da caverna. Sara foi resgatada com sucesso, mas foram interceptados por vários guardas. Maria disparou contra Mário, mas o candidato a Jedi rapidamente bloqueou os seus disparos. Lando então ativou o cronômetro de um detonador térmico e o jogou no poço de armazenamento, destruindo o edifício. Maria e os guardas fugiram, permitindo que a equipe de resgate encontrasse a Última Milênio-Luz, que foi pilotada por C-3PO e R2-D2. Antes de sair, Mário e Luigi foram desafiados por Gúri, uma Replóide. Mário aceitou o desafio e a derrotou desarmado, mas não a destruiu. Junto com Sara, Lando e Lumpy, Mário e Luigi escaparam na Última Milênio-Luz. Eles foram perseguidos pela frota privada de Maria, mas a intervenção do Esquadrão Asa Valente e da Marinha do Terceiro Império permitiu a Milênio-Luz de escapar, escoltada pelos Asas.
Logo depois, Samara Logan e seus amigos foram enviados para Lahsbane para investigar o desaparecimento dos agentes Revolucionários Tay Vanis e Yom Argo. A busca os levou de Lahsbane para Iskalon, Gamandar, Kabray e uma parada em Belderone até que finalmente terminaram se encontrando com um Vanis em coma em Arcan IV. Durante a sua passagem, Lando e Lumpy, finalmente, descobrem que Gustavo Haddad havia entregado Han Solo ao Francês em Olrox. Samara Logan traçou um plano para seu resgate.
Mário e Luigi finalmente chegaram a Olrox em 5 anos DBMC. Quando Sara e a metade da equipe de resgate havia sido presa pelo Traficante de Informações Humano conhecido com o Francês, Mário chegou para resgatar Han. A sua habilidade em usar a Força o permitiu iludir os Soldados Cartas e sua esposa Penélope, mas o Francês conseguiu dominá-lo e Mário foi servido de alimento para a sua Mãe Cogumelo.
Mário matou o monstro temível, mas o Francês indignado condenou todos os heróis da República de Maria Isabel Samara—Incluindo o prisioneiro descongelado Solo—Para morrerem comidos por um Peixe Grande no Grande Mar de Olrox, no entanto, Mário não estava destinado a ser o alimento do Grande Peixe, e justo antes de serem lançados no Grande Mar, R2-D2 e Luigi jogavaram o seu Sabre-de-Luz e libertaram os outros presos que estavam no Aeróstato Luxuoso do Francês. O candidato a Jedi dizimou os guardas do Francês, mas sofreu uma lesão leve na mão artificial.
Luigi, Mário, Han, Samus Aramovich, Sara Liliana, Lumpy, Lando e os dróides escaparam depois de matarem o Francês e destruírem o Aeróstato dele. Mara Jade, que foi colocada dentro do Palácio do Francês fazendo se passar por Akira, uma dançarina do traficante, não cumpriu a sua missão de matar Mário ou seu irmão Luigi, devido porque o Francês já iria matá-lo no poço como alimento de peixe. Mais tarde, novamente em Dagobah, Mário teve uma visão de como ela teria impedido a sua fuga.
Pouco tempo depois, Samara Logan com seus irmãos, Mega-Homem, Luigi, Samus Aramovich, Goku, Artur Link voltaram a Dagobah para completarem seus treinamentos e receberem a confirmação da morte de Yoda e do espírito de Liana May Xiang de que Mama era realmente a mãe deles, Maria Isabel Samara, uma velha Amazona Jedi que se voltou para o Lado Negro da Força. O ancião e doente Yoda contou a Mário e aos seus irmãos que o treinamento deles estava completo, mas para serem Jedi, teriam de enfrentar Darth Mama novamente, uma idéia que ele e seus irmãos acharam doloroso aceitar. Além disso, Samara Logan percebeu que Sara era sua irmã e estaria em perigo se sua mãe a encontra-se também.
Samara Logan se juntou a seus amigos na Missão em Romano para destruir o Gerador de Escudos que protegia o Segundo Núcleo de Fantomile da órbita. Quando eles se aproximaram de Romano, Mama sentiu a presença Mário e os seus irmãos na próxima batalha e então percebeu que estava pondo em risco a missão. Seus colegas ignoraram a sua preocupação e continuaram. No entanto, graças ao simples acompanhamento de Mário na missão, Mama conseguiu detectar a presença dos Revolucionários na nave que se infiltrou no mundo vulcânico, mas a terra confrontou com eles pessoalmente. Quando a equipe Revolucionária foi descoberta pelas Fantomtropas. Mário, Luigi, Mega-Homem, Artur e Sara montaram em Motos Rápidas e os perseguiu pelas densas cadeias de montanhas escuras que chegaram a relatar a presença dos Revolucionários. Mário mostrou sua habilidade nos caminhos do salto Jedi de um flutuador para o outro enquanto corriam em alta velocidade desviando o fogo inimigo, que destruiu com um golpe rápido do seu novo seu Sabre-de-Luz. No entanto, durante a rápida perseguição, Sara e Samus se separaram de Mário e Luigi. Percebendo o seu desaparecimento, Han, Mário, Luigi, Lumpy e os dróides começaram por sua busca.
Eles se perdem e são orientados pelos Wookiees e outras espécies que chegam ao planeta. Então, Mário conta a Sara sobre seu parentesco e ele e seus irmãos resolvem se entregar ao Terceiro Império para falar com sua mãe e dizerem que ainda havia um pouco de bondade nela, o que Mama nega. Mário, Luigi e os outros são levados ao Imperador, que os tenta levar para o Lado Negro e mostra-lhe as forças do Terceiro Império destruindo as naves Revolucionárias na Batalha de Romano. Quando Mário e os seus irmãos vão para atacar o Imperador, Darth Mama coloca seu Sabre-de-Luz no caminho, e começa outra luta. Por meio de telepatia, Mama descobre sobre a irmã de Mário e diz que vai trazê-la ao Lado Negro já que eles não irão. Mário então aparece, explodindo de raiva pela ameaça de Mama a Sara, e corta a mão direita de Mama. Ao ver que ele cortara a mão de sua mãe, assim como sua mãe fizera em Cúpula Meridiana, percebe que está ficando igual a ela.
O Imperador aparece, e Mário e Luigi e os irmãos dele se declaram como Jedi, assim como sua mãe antes deles, imune ao Lado Negro. Em fúria, o Imperador solta Relâmpagos da Força. Darth Mama, ao ver seus filhos agonizando com os ataques, antes de o Imperador matar Mário, com seu braço restante joga o Imperador no reator do Segundo Núcleo de Fantomile, matando-o. Mama pede para Mário e os irmãos dele tirarem a sua máscara, e diz antes de morrer: "Digam... À sua irmã de vocês... Que vocês estavam certos." (Sobre sua bondade).
Antes que ela morresse, Mama entrega o Colar com a jóia azul que a mãe dela deu a ela para eles para que compartilhassem. Mário pega uma nave e leva o corpo de Darth Mama para Romano, pouco antes do Núcleo de Fantomile ser destruído. Em um funeral Jedi, queima o corpo da mãe, que se tornou um espírito da Força, aparecendo ao lado de Liana May e Yoda.
Um dia depois, após o duelo com Darth Mama, na Batalha de Romano, enquanto ainda se recuperava dos ferimentos causados pelo Relâmpago da Força de José Fobos, Mário e Luigi salvam Den Walshi de uma amputação ou morte certa. O amigo de Mário descobriu um dróide mensageiro que ameaçava matar todos ali, solicitando ajuda para o mundo localizado na Borda de Bakura. Samara Logan liderou uma missão da República de Maria Isabel Samara ao Sistema Bakura, que foi cercado por uma estranha raça alienígena, os Ssi-ruuk, que usavam seus prisioneiros para dar energia a sua tecnologia. Ali Mário, Luigi e Sara negociaram uma trégua temporária entre os Revolucionários e as forças do Terceiro Império para trabalharem em conjunto em oposição à invasão. Mário e Luigi encontraram uma jovem Senadora Bakurana, Gaeriel Captison e acabaram desenvolvendo uma atração mútua, mas seus caminhos se separaram depois do fim da guerra. Durante a missão, Mário foi infectado com parasitas Olabrianos Tricóides por causa do traiçoeiro Governador do Terceiro Império Wilek Nereu e foi feito prisioneiro pelos Ssi-ruuk. Com a ajuda de Dev Sibwarra, uma sensitiva a Força Humana que servia aos Ssi-ruuk, Mário conseguiu escapar, inutilizando a sua nave e ganhou a batalha. Mário e Luigi opinaram sobre os termos da rendição de Wilek Nereus para que os Bakuranos tivessem liberdade de escolher a sua autoridade de governo. A descoberta de Dev Sibwarra durante a Batalha de Bakura impulsionou a determinação de Mário e Luigi de encontrar outros como ele pela Galáxia de Orião. O assalto do José e de Darth Mama não foi absoluto e ele acreditava que certamente haveria outros usuários da Força que sobreviveu aos tempos sombrios.
Depois de voltar da Bakura, Mário e Luigi foram com os pilotos do Esquadrão Asa Valente para Coréllia em uma missão de reconhecimento. Eles descobriram que o planeta estava praticamente livre da ocupação do Terceiro Império. No entanto, enquanto estavam em uma Tapcafé em Coroa, a cidade foi atacada pelo General Cara-Pálida Weir e seu exército. Os Asas Valentes contiveram as tropas de assalto enviadas depois deles, e as habilidades Jedi de Mário e Luigi foram muito úteis na defesa de pilotos contra o fogo Blaster e evitando uma queda de um FA-UTT sobre Tycho Celchu e Ten Nunb, tempo o suficiente para que eles pudessem escapar do perigo. Após a captura de Nunb, Mário e Luigi perseguiram os seus captores do Terceiro Império, mas eles deixaram o planeta. Felizmente, os Tycho e os dróides astromecânicos trouxeram seu MiG para ele. Saindo em sua busca, foi interrompido por um enganoso ataque de Caças FA-TIE contra um comboio de civis. No entanto, Mário e, o restante dos Asas Valentes seguiram a pista de Weir e Ten a Tralus, onde encontraram uma base subterrânea escondida. Depois de um breve tiroteio, Weir fugiu em um FA-TIEs e Mário, Luigi e Walshi e descobriram outros MiGs para persegui-lo. Enquanto isso, Wes Janson descobriu que Ten já estava morto, torturado e morto por Weir. Mário, Luigi e Walshi derrubaram Weir e o capturaram como prisioneiro de volta para a República de Maria Isabel Samara. Pouco depois, Mário passou a ser responsabilidade do Esquadrão para Walshi.
No entanto, Mário teve que adiar os planos de uma Nova Ordem Jedi. A morte de José Fobos levou a um tempo de atividade frenética, e Mário se viu envolvido em ajudar os planetas que queriam se separar do Terceiro Império enquanto ele estava fraco. No planeta Solay, Mário ajudou a resistência local a derrubar o Rei Blackart. Durante a luta Mário se apaixonou por uma garota local chamada Maria como a sua mãe e pela primeira vez pensou em deixar a guerra. No entanto, Mário voltou à realidade quando o Terceiro Império voltou para escravizar Solay. Maria morreu na reocupação e Mário escapou do planeta com a ajuda de um local chamado Braxas. A morte de Maria renovou o compromisso de Mário com a Revolução, e retomou aos seus deveres com um impulso renovado.
Na base da Revolução no mundo de Romano, Mário e Luigi começou a praticar seus poderes da Força com os Wookiees e os Revolucionários. Mário e Luigi ficaram até receberem a sua primeira missão oficial desde a morte de Fobos. Mário e Luigi se tornaram os representantes da vitoriosa Revolução e visitaram os planetas de Iskalon e de Shawka pedindo representantes para a Primeira Conferência dos Povos Livres. Durante sua missão, Mário encontrou o Iskaloniano Kiro. Kiro era um sensível à Força e esperava que Mário o treinasse como um Cavaleiro Jedi, entretanto a morte da Sibwarra fez que Mário questionasse sua preparação para treinar uma nova geração de Cavaleiros Jedi e recusou o pedido de Kiro. Kiro estava visivelmente incomodado, mas aceitou a visão de Mário. A esta altura, Mário e Luigi começaram a treinar mais recrutas para a República de Maria Isabel Samara, incluindo Barney, Rik Duel, Chihdo, Dracos, Dani e Faron. Embora eles talvez não fossem sensíveis à Força também queria ser treinados como Cavaleiros Jedi, mas Mário tinha decidido que o medo de que os novos Jedi cairiam para o Lado Negro impediu de treiná-los na Força. Infelizmente, a decisão de Mário depois iria assombrá-lo.
Durante seu tempo como comandante do esquadrão, outra jovem Revolucionária chamada Vila chegou ao mundo vulcânico, exigindo que Mário a treinasse para que ela pudesse salvar seu mundo natal de Nalder. Mário manteve suas, e embora prometesse ajudar a Vila, não a treinaria. O medo de Mário de treinar novos Jedi foi testado em Nalder onde ele entrou em conflito com Flinte, outro jovem que havia se recusado a treinar. Flinte se tornou um Lorde Sith sob Lumiya e liderou as forças do Terceiro Império em Nalder. Mário lutou contra o Lorde Negro e percebeu que a sua recusa em treinar Flinte tinha de fato criado o mal ao invés de detê-lo. Mário pode fazer com que Flinte pudesse perceber que ele havia se perdido, mas a batalha custou à vida de Vila. Flinte foi levado sob custódia pela República de Maria Isabel Samara e uma visão da força com Yoda, Liana May Xiang e da redimida Maria Isabel Samara fez com que Mário e Luigi percebessem que eles não tinham mais a temer o Lado Negro. Mário e Luigi decidiram aceitar o pedido de Kiro e assim ele se tornou o primeiro Aprendiz de Mário.
Antes que ele começasse a treinar, Mário e Luigi estavam envolvidos na Guerra Nagai-Tof. O Comandante Nagai Ozrei N'takkilomandrife tinha criado os combates entre os Revolucionários em Saijo, e Mário, Luigi, Sara Liliana, Artur Link, Samus e Han resolveram a disputa ao descobrirem ao traidor Durne. Entretanto, este foi apenas o princípio do conflito, e em uma verificação de rotina em Kinooine, Mário e Luigi ficaram cara a cara com o poder da maquinaria de guerra Nagai. Junto com Kiro e Dani, Mário sondou o planeta, à procura de um grupo de exploradores perdidos. Mário não sabia que grupo havia sido executado por Lumiya e seu ajudante Nagai, Den Siva. Dani e Kiro encontraram à perigosa Lady Sith antes de Mário, Luigi e Kiro serem feridos gravemente e Dani ser capturada por Den Siva. Mário enfrentou Lumiya, mas sofreu uma de suas primeiras derrotas, quando ela o atacou com o seu Chicote-de-Luz. Mário foi capturado e enviado para uma cela subterrânea no planeta.
Felizmente, Kiro se recuperou de seus ferimentos mais graves e decidiu salvar seu Mestre e Dani. Kiro se infiltrou na prisão, matando os Guardas Nagai, depois liberou Mário e ajudou a criar uma Shoto. Kiro e Mário enfrentaram novamente Lumiya, e o resultado foi completamente diferente. Mário usou seus dois sabres contra o Chicote de Lumiya, e a Lady Negra foi derrotada. Mário a desmascarou e se surpreendeu ao saber que era realmente era Shira Brie, seu antigo amor. Infelizmente, a Frota Nagai chegou nesse momento, e Kiro e Mário tiveram de levar sua prisioneira e se esconderem. No entanto, eles tinham outro problema, quando eles tinham que amarrar Lumiya para resgatarem Dani. Kiro e Mário resgataram a Zeltron, mas a fuga foi frustrada por Den Siva, que atacou e feriu gravemente Kiro, deixando-o morto nas águas do Kinooine. Mário e Dani tiveram que fugir rapidamente, acreditando que Kiro tinha morrido. Mário tinha perdido outro Aprendiz em potencial e Lumiya escapou de seu cativeiro.
A guerra continuou durante a Batalha do Romano onde as forças da República de Maria Isabel Samara enfrentaram diretamente os Nagai. No espaço, as forças lideradas por Lumiya quase destruíram a Frota da República de Maria Isabel Samara, mas a liderança de Mário na superfície e as táticas espaciais de Lando procuraram a vitória. Com a gravidade da ameaça Nagai, Mário teve um papel mais central em combatê-los. Na Batalha de Iskalon, Mário e Luigi enfrentaram às forças do General Kruskob Tiltanka, eliminando a presença Nagai no planeta. Mário se encontrou com seu Aprendiz Kiro, mas este decidiu ficar em Iskalon para proteger seu povo. A decisão de Kiro entristeceu Mário, mas ele aceitou.
A guerra mudou novamente quando os inimigos mortais dos Nagai, os Tofs, entraram na guerra, na Doceava Batalha de Zeltros. Mário teve que lutar contra os Tofs e o Império Hiromi quando invadiram Zeltros, ameaçando a vida de Dani, Sara, Luigi, Samus e dos Nagais. O assalto de Mário ajudou a capturar uma nave Hiromi, terminando a batalha com a ameaça do Império Hiromi. A batalha final da guerra foi a Batalha de Saijo, depois de que a República de Maria Isabel Samara ficou do lado dos Nagais contra os Tofs. Mário liderou a equipe que capturou o líder Tof, o Príncipe Sereno.
Nesse ano, Mário, Luigi e o Almirante Ackbar viajaram para Mon Calamari para impedir que Trioculus obtivesse a Luva de Darth Mama no fundo do oceano. Mário pode evitar os ataques de Trioculus e derrotou seu parceiro (O Capitão Dunwell da nave), mas Trioculus escapou com a luva. Mário, aconselhado pelo espírito de Liana May Xiang, procurou a Cidade Perdida dos Jedi em Yavin IV. Na Cidade Perdida vivia um garoto chamado Ken, uma vez um Príncipe Jedi. No entanto, o Supremo Profeta do Lado Negro Kadann declarou que Ken era uma ameaça para o governo do Terceiro Império de Trioculus e tentou encontrá-lo e destruí-lo. O que Mário não sabia era que Kadann era um impostor e que era uma marionete de Trioculus colocada pelo Grande Capitão Cara-Pálida Hissa e do restante do Comitê Central de Grandes Capitães e Generais Cara-Pálidas. Embora o falso Kadann capturasse Ken, Mário ajudou Ken e, em seguida, escapou capturou o falso Kadann e as suas tropas na Cidade Perdida depois de ter a certeza que não podiam recuperar a informação guardada em um computador. Mário, Luigui e Ken deixaram a lua, e depois Mário ajudou o pai de Ken, Triclops a escapar, de um hospital psiquiátrico em Duro. O Grande Almirante Makati depois deteve a ameaça do falso Kadann.
Mário foi um membro vital da Aliança de Planetas Livres, e depois da República Federativa da Galáxia. Ele era um agente da Rede de Inteligência Interplanetária do Senado, que durou pouco. Depois de sua excelente tática ao defender a Encouraçada Nova Esperança em Milagrosa permitiram a República Federativa da Galáxia capturasse um Aeróstato Estrelar (Que se converteria no Crynyd), Samara Logan foi promovido a General. No entanto, ele não gostou do comando militar e depois de derrotar as forças do Lorde Peãosombrio lutando até o último homem nos sangrentos campos de batalha de Mindor, Samara Logan ficou impressionado com a enorme perda de vida e renunciou ao seu comando militar apenas seis meses após a sua promoção. Sua decisão de deixar o exército, depois, seria usada contra ele por alguns políticos Anti-Jedi.
Mário também estava em uma missão em Hanoon para libertar seu povo e obter os pedaços do Vor'Na'Tu, um poderoso artefato da Força, depois de que o espírito do Mestre Jedi Echuu Shen-Jon disse que ele e Sara o fizessem. Embora o artefato fosse destruído e o povo de Hanoon foi libertado do jugo do Terceiro Império. Por esta altura Mário encontrou Tyria Sarkin, uma nova piloto República Federativa da Galáxia com sensibilidade marginal à Força. Mário infelizmente lhe disse que não estava disciplinada a suficiente naquela época para ser treinada como Jedi.
Enquanto Mário continuasse procurando sensíveis à Força e outros restos do legado dos Jedi, ainda ajudava a seus amigos e à República Federativa da Galáxia. Ele voou em seu MiG e acompanhou Lando Calrissian na Avatar Plataforma Orbital para ajudar Han e Lumpy a resgatarem os escravos Wookiees da plataforma. Mário também acompanhou a infantaria da República de Maria Isabel Samara sob Kant Talor em seu último ataque contra o Palácio do Terceiro Império em Coruscante na batalha para livrar o planeta. Nesta mesma época ele foi a Toola e em Kessel para libertar os prisioneiros lá com a ajuda de Han Solo, Lando, Lumpy, Luigi, Mega-Homem e vários Revolucionários Wookiees que religaram as usinas de ar e salvaram o planeta.
Em 8 anos DBMC, Sara Liliana Samara Logan estava sendo cortejada pelo Príncipe HapanoC Isolder que queria sua mão em casamento. Em resposta, Han Solo raptou Sara e fugiu com ela para um planeta desconhecido. A Galáxia de Orião ficou chocada com o aparente seqüestro envolvendo duas das mais famosas da figuras da Revolução. Mário e Luigi investigaram e encontraram a alguns investigadores Hapanos atacando à Caudilha Drackamariana Omogg. Ele os deteve e uma agradecida Omogg deu o nome e a localização do planeta que Han tinha ganhado em um jogo de Sabacc, onde Han havia levado Sara Liliana: Dathomir. R2-D2, Luigi, Samus e Mário viajaram com Isolder para a Montanha da Cantareira para Dathomir, onde fingiu sua morte e, usando a Força, e controlou sua descida pela atmosfera. Durante suas aventuras em Dathomir Mário ensinou a Isolder os princípios da Força, apesar de Isolder não ser sensível. No planeta, Mário descobriu as ruínas da Chu'unthor, uma nave de treinamento Jedi antiga e uma cultura inteira de bruxas Sensíveis à Força. Mário era uma raridade entre os Dathomiris, pois não havia "Bruxos" masculinos. Uma das bruxas mais jovens, Teneniel Djo, foi atraída para Mário, mas depois teve interesse em Isolder e, eventualmente, se casaria com ele. Mário e Luigi decidiram ajudar o Clã Teneniel Djo contra as seguidoras do Lado Negro em Dathomir, as Irmãs da Noite. Nesta batalha quase mataram sua líder Gethzerion, mas curou-se em apenas algumas horas usando a Força. Então ele pilotaria a Última Milênio-Luz. Operando ele sozinho todos os sistemas, usando o poder da Força para aumentar significativamente a eficácia da nave, e Han Solo foi salvou da morte certa pelas mãos de Gethzerion. Usando a Milênio-Luz, Mário bateu no transporte de Gethzerion, matando todos a bordo, e desativou a capa noturna orbita posta em órbita por Zsinj.
Depois destes acontecimentos, a procura por Jedi de Samara Logan se intensificou e o espírito de Liana May Xiang, mais uma vez o visitou. Xiang deu-lhe um último adeus em 9 anos DBMC, pois já não o visitaria. Samara Logan, apesar de triste, ele sabia que não era o último dos antigos Jedi, mas o primeiro dos novos.
A próxima crise que Samara Logan teve de enfrentar foi o retorno do Grande Almirante Cara-Pálida Mitth'raw'nuruodo ou Thrawn, além de suas naves e Encouraçados, Mário pensou que estava caindo para o Lado Negro e buscou as respostas com sua velha Mestra, Liana May Xiang. Durante seu regresso a escuridão, Thrawn tentou apanhar Mário, em várias ocasiões, mas o Jedi conseguiu escapar de seus perseguidores, embora às vezes apenas por muito pouco. Quando Han, Luigi Samus e Sara fizeram uma viagem para Bimmisaari, Mário foi emboscado por um grupo de comandos Noghri. Em outra ocasião, seu MiG foi interditado pelo Aeróstato Estrelar de Thrawn. Mário conseguiu escapar do raio trator, mas danificou seu hiperpropulsor e estava à deriva no espaço. Mário foi resgatado pelo chefe contrabandista Talon Karrde, que se escondeu de Thrawn, embora o tenha permanecido mais ou menos seqüestrado até que ele pensasse sobre o que fazer com ele. Karrde apresentou Mário a sua parceira Mara Jade, que rapidamente formou uma relação antagônica com Mário. A feroz guerreira sensível à Força, Mara era uma vez uma agente mortal de Fobos, uma das "Mãos do Imperador", um grupo de Jedi Negras que podiam escutar o chamado do Imperador através da Galáxia de Orião. Jade culpou Samara Logan como o responsável pela destruição da vida e propósito, e queria matá-lo.
Quando Thrawn inesperadamente veio a Myrkr, Karrde colocou Mário em um galpão. Mário escapou, liberou R2-D2 e roubou um Skypray Blastboat, mas Mara Jade o perseguiu. Ambas as aeronaves caíram, e Mário, Mara e R2-D2 foram capturados no bosque cego à Força de Myrkr. Apesar dos repetidos ataques dos Vornskrs, Mara manteve Mário prisioneiro. Usando a conexão em nível de equilíbrio de R2-D2 com o MiG de Mário, puderam enviar uma mensagem segura a Karrde. Quando saíram da floresta, Mário e Mara entraram, na Cidade Hyllyard, patrulhada pelas Fantomtropas de Thrawn. No entanto, Karrde enviou alguns de seus parceiros, junto com Lando e Han, para emboscar as Fantomtropas e ajudar Mário a escapar.
Embora começava a Campanha Thrawn, surgiram rumores de um Mestre Jedi estava escondido no remoto planeta Jomark. Depois de deixar Myrkr, Samara Logan participou de diversas missões, algumas pessoais e algumas para a República Federativa da Galáxia. Esteve presente na primeira incursão do Terceiro Império em Nkllon, ajudando a resolver uma disputa em Nova Cov, visitou Honoghr (Onde ele foi reconhecido como o filho de Darth Mama) e, mais significativamente, ele investigou e descobriu o clone insano do Jedi Negro, Joruus C'baoth. Por um tempo Mário estudou com C'baoth em Jomark, mas estava confuso com as condutas excêntricas e bruscas do ancião. O ponto de ruptura veio quando Mara Jade chegou para pedir ajuda para salvar Mário de Talon Karrde, que haviam sido capturados pelo Terceiro Império. Usando um Ysalamir para afastar a influência de C'baoth de Mário, e com a ajuda de R2, Mara conseguiu afastar o louco Mestre Jedi de Mário. Embora houvesse vários inconvenientes na operação de resgate, e outra viagem a um triturador de resíduos alimentares, Mário resgatou Karrde de Thrawn, pagando-lhe o favor. Mário guerreou contra o Almirante Thrawn, tornou-se um verdadeiro Cavaleiro Jedi ao enfrentá-lo, ou a prova do espírito.
A crise causada por Thrawn fez que Samara Logan e Jade passassem grande parte do tempo juntos e, lentamente, desenvolveram um relacionamento. Apesar das várias oportunidades, Jade não matou Samara Logan, e os dois trabalharam juntos para derrotar o Grande Almirante Cara-Pálida e C'baoth. Jade, deixando de lado seu ódio com Samara Logan, relutantemente, desenvolveu uma relação com Mário e as suas habilidades, especialmente depois que ela soube que Thrawn estava usando os clones de para criar uma fonte infinita de tropas. Na batalha da Frota Katana, o Caça de Mara foi atingido por um Canhão de íons. Ela escapou da nave, mas podia ter morrido no vácuo do espaço, se não fosse porque ela encontrou Mário com a Força. Após Mara revelar a localização da instalação de clonagem de Thrawn, ela foi (Depois de ser libertada de uma prisão) com Mário, Luigi, Samus Mega-Homem, Lumpy, R2, Han e C-3PO para Wayland acabar com a ameaça.
Ao viajar pelas florestas perigosas de Wayland, Mário teve tempo para expandir o treinamento de Mara, enquanto viajavam para a Fortaleza do Monte Tantiss. Uma vez no Monte Tantiss, Mário e Mara procuraram o botão de autodestruição na câmara do Imperador, embora fossem limitados pela cegueira da Força causada pelos Ysalamiri. Encontraram C'baoth esperando lá, Samara Logan tentou convencê-lo a renunciar ao Lado Negro, mas a loucura de C'baoth era muito forte para desfazê-la, e tentando transformar Mário em seu novo Aprendiz do Lado Negro, C'baoth fez o impensável. Usando a mão decepada de Samara Logan, recuperada de Cúpula Meridiana por agentes do Terceiro Império, C'baoth criou um clone do jovem Jedi―Máario Samara Logan, e ordenou ao clone sem mente de Samara Logan para matar no Monte Tantiss. Ao mesmo tempo, tropas do Terceiro Império controladas por C'baoth destruíram a Instalação Ysalamiri, restabelecendo a ligação de Mário (E C'baoth) na Força. Mário lutou ferozmente contra seu clone, embora fosse Mara Jade que derrotou C'baoth e o clone, cumprindo a última ordem dada pelo Imperador.
Embora o Grande Almirante Thrawn fosse derrotado, sua vitória fez os Remanescentes de Fobos forjarem um ataque espetacular em Coruscante, capital da República Federativa da Galáxia. Enquanto que Thrawn queria capturar a capital intacta, estes agentes do Terceiro Império atacaram sem limitações e devastaram a alguma vez brilhante ecumenópolis. A República recuou e levou Samara Logan em diversas missões ao planeta agora do Terceiro Império.
Apanhado em Coruscante em 10 anos DBMC, Samara Logan estranhas pistas em câmaras secretas recentemente abertas em todo o Palácio do Terceiro Império, pistas do poder do Imperador. Antes que ele pudesse esclarecer o seu significado, uma Tempestade da Força apareceu no céu. O vórtice de energia consumiu Samara Logan e R2-D2, e os colocou em uma Nave Calabouço do Terceiro Império rumo ao planeta Bismo no Núcleo Profundo. Lá, em uma ornamentada Cidadela, Samara Logan enfrentou um inimigo que não espera ver de novo: o Imperador José Cesar Fobos.
O espírito de Fobos havia escapado da morte com o uso de conhecimento oculto Sith e tecnologia de clonagem Spaarti. José criou duplicatas clone de seu corpo para servirem como ferramentas para a sua força vital do mal quando seu corpo original morresse. Com esta técnica, José Cesar Fobos havia escapado da morte a bordo do Segundo Núcleo de Fantomile e agora chamava Samara Logan para ajoelhar-se diante dele e tornar-se seu servo. Samara Logan, sabendo que o Imperador era quase invencível, ajoelhou-se diante dele e concordou em se juntar ao Lado Negro e aprender os caminhos dos Sith.
Como alguns outros na história registrada, ele acreditou que poderia vencer o Lado Negro por dentro, aprendendo os seus segredos. Ele ignorou uma das lições fundamentais de Yoda: Nunca subestime o poder do Lado Negro. Samara Logan trabalhou para o Lado Negro nas sombras, como tinha feito Quinlan Vos nas Guerras Clônicas. E como Mestre Jedi, Mário descobriu que não podia escapar de sua rede porque estava muito envolvido com o Lado Negro. Enquanto era um Aprendiz Sith, Mário adquiriu dois clones sentinelas mutante para servir ao Lado Negro. Embora ele conseguisse secretamente sabotar diversos planos de Fobos, incluindo um ataque contra os Devastadores Mundiais em Mon Calamari, ele estava submerso na escuridão para pensar claramente.
Quando Sara e Samus chegaram a Bismo para resgatá-lo elas mesmas foram capturadas, juntamente com Han, no entanto, a presença do Lado da Luz de Samus e Sara permitiu Mário de escapar por pouco do Lado Negro, dando a iniciativa de rebelar-se completamente contra Fobos. Ele ajudou Sara, Samus e Han a escaparem e deu os códigos de interface que controlava os Devastadores Mundiais de Mon Calamari. Ele então atacou José Fobos.
Em uma tentativa frustrada de assassinato, ele foi para o laboratório de clonagem e destruiu os tanques de clones logo após o tempo do atual corpo de José Fobos acabou. No entanto, antes que pudesse terminar, Fobos conseguiu se transferir para um dos últimos clones vivos, quando Mário tentou subjugar José, dizendo que seu tempo como o Aprendiz do Lorde Negro tinha mostrado as suas debilidades, José Fobos riu dele e tomou um dos Sabres-de-Luz que tinha no laboratório. Seguido por um curto duelo de Sabre-de-luz, em que Mário foi facilmente derrotado.
José Fobos, em seguida, viajou para a Base Cúpula em sua nave-capitânia, o Eclipse, levando um Mário derrotado. No entanto, com a ajuda de suas irmãs Sara e Samus, Mário conseguiu derrotar a escuridão que o consumia e se voltou contra seu Mestre. Samara Logan finalmente consegue derrotar José Fobos em um combate corpo a corpo.
No entanto, José Fobos convocou uma enorme Tempestade da Força, que começou a destruir a Frota da República Federativa da Galáxia ao redor da Base Cúpula. Mário junto com Sara e Samus criaram uma enorme onda de energia do Lado da Luz que impediu que José Fobos controlasse a tempestade, que se voltou contra ele. Enquanto eles fugiram o Eclipse foi destruído, e com ele a encarnação atual de Fobos.
Mas a sombra do Lado Negro continuou atormentando Samara Logan. Tendo em vista o grande número de sensíveis à Força sob o controle de José Fobos, Samara Logan estava determinado a reconstruir a Ordem Jedi. Enquanto isso Fobos, em um novo corpo, chamou os seus servos para Bismo, em sua nova Arma Galáctica. Samara Logan foi até Ossus para encontrar relíquias Jedi, observando o antigo Holocron de Bodo Baas. Enquanto explorava juntamente com Kam Solusar os mistérios do planeta, com uma história rica, foi atacado por um grupo de Elite de Lado Negro, leais a José Fobos, que tentaram capturar o Holocron para o Mestre renascido.
José Fobos assumiu a sua nova nave-capitânia, a Eclipse II, indo para Onderon pretendo o corpo da recém-nascida Maria Isabel Solo. Mário, Luigi e seus novos companheiros de equipe Jedi, Kam Solusar, Rayf Ysanna e Empatojayos Brand, embarcaram na nave, mas José tinha ido embora. R2-D2 colocou a nave espacial em rota de colisão com a Arma Galáctica. Enquanto isso, José Fobos encontrou Sara, Samus, Artur Link e Han na superfície de Onderon, mas Mário e seus companheiros chegaram para ajudar. Este foi seguido por um duelo feroz onde Rayf Ysanna foi morto e Empatojayos Brand foi ferido mortalmente. No entanto, Han Solo atirou em José Fobos pelas costas. O espírito negro, então voou para Maria, mas Brand o pegou e levou à ameaça de José Cesar Fobos com ele até a morte nas Profundezas da Força.
Imediatamente após a morte de Fobos, a República retornou a Coruscante e iniciou a sua reconstrução. Mário, entretanto decidiu que era hora de começar um Praxeum, uma Academia Jedi para ter uma base para Cavaleiros Jedi e no futuro construir uma Nova Ordem, que poderia defender a Galáxia de Orião dos enganosos políticos da República. Mário via como suas irmãs se afastavam do caminho dos Jedi se sacrificando para uma vida conjugal e se dedicou a procurar adeptos da Força com a ajuda dos computadores e de tecnologia recém-descoberta do Terceiro Império para detectar o nível da Força, junto com seus poderes também.
Quando ele dirigiu-se a Sha Eol e recrutou o jovem Gantoris, um condenado à morte como herege. Mais tarde foi para Cúpula Meridiana para visitar o velho eremita Streen e depois conseguiu que outros Jedi conhecessem a sua existência como Kam Solusar, Corran Horn, Kyle Katarne e a cronista Tionne e para que voltassem para seu lado depois de ganhar a confiança deles, por enquanto Mário era um servo de José Fobos e estava prestes a matar todos. Ele foi para avin e converteu o Grande Templo Massasi em uma Academia auto-suficiente para viverem e aprenderem isolados das tentações do mundo civilizado, escutando à Força e inclusive os sermões do Liana May Xiang, que ainda estava falando e falando. Elas acrescentariam outros como Kyp Durron, e até a própria Mara Jade... Outros foram, Horn, Jade ou Katarne ficaram, mas a turma de doze alunos em breve seria aumentada, enquanto a República estava enfrentando a agente do Terceiro Império Daala.
Mário e Tionne extraíram muita informação do Holocron antes de ser destruído pelo espírito de José Fobos, que foi convocado depois de uma sessão imprudente. Mário decidiu procurar Durron e quando o encontrou já se libertou da influência dos Sith e voltou para os Jedi.
Mário foi um Mestre muito aberto e deixava os estudantes muito se aventurarem em selvas para descobrirem seu próprio caminho e explorar. Falava muito com eles da Força e da história do Jedi, e ensinava-os a usar a Força para resistir a um banho de água fervente, ensinava-lhes a levitar pedras e R2-D2, e alerta eles para as tentações do caminho do mal e ensinou a moral dos Jedi... Em pouco mais de um ano, os alunos tornaram-se Cavaleiros Jedi com seus próprios Sabres-de-Luz e já viajavam sozinhos por toda a Galáxia de Orião, levando mais estudantes para a Academia de líder Mário.
Já era o ano 12 anos DBMC que Mário junto com Kyle Katarne enfrentou à invasão de Desann e seus agentes do Terceiro Império. Ajudou Kyle a recuperar seu vínculo com a Força e procurou Desann, seu antigo Aprendiz e agora caiu para o Lado Negro. Ele foi ajudar Katarne na base do Terceiro Império dos nos asteróides de Lênico e enfrentou Desann, mas este despareceu para atacar o Praxeum. Mário, seus estudantes e outros Jedi incluindo Katarne chegaram à lua para impedir um massacre com ajuda de uns poucos soldados da Republica descontentes com a atual República. Katarne acabou com Desann e Mário e seus Jedi varreram o Desann Renascido.
Dois anos depois, a Aprendiza de Desann, Tavion, voltaria novamente para retirar as forças de diferentes lugares, ferindo muitos civis. Mário, Luigi, Kyle Katarne e seu Aprendiz Jaden Korr a impediriam também, assim como a ressurreição do Sith Marka Ragnos. Depois enfrentarem vários Jedi Negros, que o velho Mário os considerava inútil, assim como os restos dos Renascidos e o monstro Waru. Mário ainda sonhava com a Jedi Callista. Um amor que recentemente tinha se despedido após enfrentarem juntos a batalha do Olho de Fobos, e o Projeto SabreNegro...
Em 16 anos DBMC Mário decidiu deixar aos Jedi crescerem por si mesmos e começou a encarregar as primeiras funções ao que seria o Mestre Streen e seu mordomo. Mário se retirou ao Coruscante, para o palácio de sua mãe. Ali foi visitado por uma jovem chamada Akanah que dizia conhecer seu pai. Entretanto tudo era uma mentira para conseguir sua ajuda para encontrar seus irmãos desaparecidos na Força. Isto os levou aos dois até centro da Crise Yevethana da Frota Negra. Pouco depois Mário e Luigi tiveram que encarregarem-se de investigar dois Aprendizes Jedi caídos; Kueller e Brakiss. O primeiro foi derrotado e morto por Sara Liliana Samara Logan e Samus Aramovich; mas o segundo escapou. Mário foi visitar Han Solo para lhe pedir explicações sobre sua irmã, mas Sara estava hospitalizada porque tinha tido uma colapso nervoso.
Mário se encontrou com Galadriel, a retirada, que o advertiu quando chegasse o momento ele teria que atuar como líder, especialmente dos Jedi, e aprender sobre diplomacia e política, como ela havia feito sua irmã. Mário riu na cara desta falsa mulher, embora no final procurasse ajuda a planetas aliados para conseguir uma frota, que obteve em Bakura, para fazer frente aos rebeldes Corellianos. Depois de descobrir um complô Socorriano que tinha incitado rebeliões em todos os planetas e utilizava Centrália como arma de destruição em massa e Mário se reencontrou com a Mara Jade e sua irmã, que renunciaria após a crise.
Um ano depois, a República Federativa da Galáxia ameaçava se desmoronar quando ele encontrou o Documento Caamas, um arquivo do Terceiro Império envolvendo um grupo de Bothanos no bombardeio orbital de Caamas, provavelmente ordenado por José Cesar Fobos. No entanto, o documento foi alterado para incluir os nomes de um grande número de clãs pertencentes a importantes Bothanos que não tinham nada a ver com o ataque. Quando a crise começou, Mário procurou a ajuda de Han Solo para o desenvolvimento das negociações entre Ishori e Diamala. Enquanto se defendiam de um ataque pirata, Mário começou a fomentar os seus poderes n a Força para derrotá-los, mas percebeu que isso poderia levá-lo para o Lado Negro.
Mário sentiu que os piratas com os quais ele lutava, eram clones. Curiosamente, Mário conseguiu finalmente que os Piratas Piratas Cavrilhu voltassem à sua base. Samara Logan conseguiu se infiltrar na base, mas foi descoberto e quase capturado pelos bandidos foragidos. Mas ele fugiu e foi resgatado por Mara Jade pouco antes da base se autodestruir.
Mário visitou um tempo depois Nirauan, para procurar por Mara, que tinha sido enviada para lá para investigar um estranha nova nave alienígena. Ele precisava ir, depois de ter uma visão de Mara flutuando em um tanque de água. Após o encontro com Mara, eles e R2 e conseguiram chegar à proximidade da fortaleza do Império da Mão (Conhecido como Mão de Thrawn) e danificaram a baía de embarque para evitar que os agentes do Terceiro Império contatassem com os Remanescentes de Fobos. Depois disso, Mário, Luigi, Mara, e R2 poderiam voltar para a fortaleza para obter uma cópia do Documento Caamas. Com a ajuda de nativos Qom Qae e Qom Jha, Mário e Mara entraram na fortaleza, lutando contra um grande contingente de Guerreiros Chiss equipados com ysalamiri e Charrics. No processo, destruíram um clone imaturo de Thrawn e grande parte da fortaleza. Enquanto lutavam para escapar dos guardas dróides Mário e Mara viram uma União na Força, podendo verem entre eles, suas emoções e conflitos internos.
Seus romances fracassaram juntamente com as tensões produzidas em seu papel como Mestre Jedi, muitas vezes, pareciam indicar que Mário iria seguir os passos de seu mentor e manter uma vida de solidão. No entanto, apesar das dificuldades encontrou o amor em uma pessoa próxima a ele. Durante o incidente do Documento do Caamas em Nirauan, o relacionamento de Mário e Mara cresceu a ponto de Mário propor casamento com a antiga Mão do Imperador. E ela aceitou.
Cerca de uma década após o seu primeiro encontro hostil, Samara Logan e Jade se casaram em Coruscante em duas cerimônias, uma cerimônia privada celebrada no Quartel-General Jedi, e uma segunda celebração pública foi quase arruinada por fundamentalistas do Terceiro Império. Mário não poderia se preocupar com esse problema, enquanto seus amigos acabavam com infiltrados e, finalmente, o casamento continuou sem maiores incidentes.
Quase um ano depois, Mário, acompanhou de Mara, trabalhando na avaliação de uma disputa (Muitas de nível altíssimo) em um planeta onde os Jedi eram adorados. Lá, Mário decidiu levar sua esposa para uma segunda lua de mel, graças a um de seus contatos locais, assumindo um grande alívio para ambos.
Mário e Mara viajariam juntos em várias ocasiões, para descobrirem os restos da Viagem de Expansão Jedi durante 23 e 24 anos DBMC Mário permaneceu junto a Tionne de novo no posto da Academia enquanto seus Jedi enfrentavam o Segundo Império e a Academia Sombria em Brakiss, a Aliança da Diversidade e o Sol Negro.
Agora, a Nova Ordem Jedi enfrentava seu maior desafio. Sem a orientação de um Conselho Jedi, faltava nos Cavaleiros Jedi nova união e foco. Muitos foram acusados de vigilantismo imprudente, e os cidadãos da República começaram a suspeitar de seus protetores. Seguido o pior, pois os invasores extragalácticos Yuuzhan Vongs chegaram com a intenção de conquista. Os Jedi se tornaram a primeira linha de defesa da República Federativa da Galáxia, mas a sua incapacidade para repelir os alienígenas brutais foi amplamente divulgado. Incidentes como a Batalha de Osarian e a destruição de Ithor levaram o Senado e o público a irem contra os Jedi. Estranhamente, os Yuuzhan Vongs não existiam na Força, e por isso os Jedi não poderiam usar suas habilidades mais poderosas contra esse novo inimigo. Isto causou graves problemas para os Jedi, que questionaram se o problema era dos Yuuzhan Vongs, da Força ou de si mesmos. Mário foi levado a crer que o problema era com os Jedi, pois seu próprio treinamento foi muito rápido.
Os Yuuzhan Vong se interessaram especificamente nos Jedi, proclamando-se os piores em uma galáxia cheia de infiéis. Após a Batalha de Duro, em que Jacinto venceu o Mestre de Guerra Tsavong Lah em um duelo para salvar sua mãe, Lah anunciou que iria manter a paz na galáxia, se enviasse para todos os Jedi aos Yuuzhan Vongs. Muitos na República Federativa da Galáxia se voltaram contra os Jedi, em um esforço para acalmar os Yuuzhan Vongs e parar a invasão destrutiva. Organizações como a Brigada de Paz traíram a ordem e começaram a capturarem Jedi para os invasores. Após os Yuuzhan Vongs destruírem a Academia Jedi em Yavin IV, matando o Mestre Ikrit e transformando Tahiri Veila no processo, forçando os jovens Jedi começarem um exílio. Era como se retornassem os tempos negros do Império de José Fobos. Jedi teimosos como Kyp Durron pediram ações agressivas para combater a ameaça dos Yuuzhan Vongs. Durron atraiu muito dos candidatos Jedi para trabalharem de forma independente, um movimento que dividiu profundamente a Ordem Jedi. Skywalker sabia que o medo e o caminho agressivo levariam seus Jedi para o Lado Negro. Ao invés de uma agressiva contra-ofensiva, Mário pediu a ajuda de Han e Sara, que criaram uma rede clandestina de fugitivos, o chamado Grande Rio, e dois agentes secretos chamados de Refúgio e a Estação Eclipse para proteger os Cavaleiros Jedi cercados.
Quando sua amada esposa foi afetada por uma doença Yuuzhan Vong e seus amigos mais próximos foram afetados pela violência, Samara Logan e seu irmão Luigi descobriram que nem sequer um Mestre Jedi podia manter os eventos galácticos longe de seu coração. Durante estes anos de guerra não somente Mara se recuperou de sua doença, mas também ficou grávida e deu a luz a Ben Logan. A segurança de seu filho recém-nascido se converteu em uma preocupação importante para Mário. Dados os perigos que enfrentava a Galáxia, Mário enviou Ben e a outras crianças à Instalação Maw. Embora Mário fez isto para proteger a seu filho, isto fez com que Ben se distanciasse de Mário e Mara.
Ao mesmo tempo, o anti-Jediismo do Senado alcançou seu ponto culminante e forçou o 4Chefe de Estado Borsk Fey'lya a autorizar a prisão de Mário, Luigi e Mara. Apesar de que Borsk assegurou a eles que a prisão era somente para evitar uma proposta mais extrema, ficou claro que os Jedi já não eram bem-vindos na República Federativa da Galáxia.
Os Yuuzhan Vong declararam a trégua quebrada depois de que seu plano de capturar a todos os Jedi falhou e Kyp Durron enganou o Exército da República Federativa da Galáxia para destruir uma nova Nave-Mundo. Depois veio a ameaça Voxyn, mais letal que do que a Brigada da Paz. Depois de voltarem na Estação Eclipse, Mário aprovou a Missão a Myrkr. Enquanto isso, no Senado em Coruscante, chegou o ponto decisivo para os Jedi quando Borsk Fey'lya abertamente se comprometeu o seu sistema natal para apoiarem os Jedi para combater a demanda de Nom Anor. Ao mesmo tempo Mário juntou com êxito Kyp Durron, Saba Sebatyne e seus esquadrões à Ordem Jedi prometendo a eles que iria liderar os Jedi na batalha contra os Yuuzhan Vongs. Voltando para frente, Mário se dirigiu na metade dos Jedi e quase todos os Mestres da Galáxia para resgatarem os reféns na órbita de Talfáglio. Com a força combinada do Esquadrão Conhecimento, o Esquadrão Choque, os Cavalheiros Selvagens, a Dúzia Kyp e reforços da República Federativa da Galáxia, os Jedi rapidamente venceram os Yuuzhan Vongs e resgataram quase todos, com a sorte de capturarem um Yammosk. Junto com o Borsk Fey'lya, Mário usou a contundente vitória para rebater a organização anti-Jedi do Senado e conseguir o apoio e cooperação do Exército da República Federativa da Galáxia com as atividades Jedi.
Após a Queda de Reecee, Mário tentou capturar um Yammosk vivo quando Booster Terrik atraiu uma frota inimiga para a Estação Eclipse. O plano falhou, pois Tsavong Lah havia instruído seus subordinados para destruírem qualquer Yammosk que pudesse cair nas mãos dos Jedi. Mário, em seguida, levou os Jedi para participarem de uma força-tarefa de novecentas naves que danificaram severamente uma Frota Yuuzhan Vong na Nebulosa Bantha Negra, e conseguiu capturar uma Yammosk viva.
Quando finalmente parecia que as coisas iriam melhorar para os Jedi, vários eventos ocorreram parecendo um pesadelo: A morte de Maria Isabel Solo em Myrkr, a filtração das coordenadas da Estação Eclipse, a Queda de Coruscante e a bem-sucedida tentativa da traidora Viqi Shesh de seqüestrar Ben.
Apesar de unir forças com a Frota do Grupo Três do General Den Walshi, a frota invasora de Tsavong Lah executou vários Jedi. Os Jedi conseguiram destruir vários Yammosks e a nave-capitânia de Lah, a Sunulok, o Esquadrão Jedi pagou um alto preço. Mário e Mara, dois dos melhores pilotos Jedi na Galáxia foram derrubados em seus MiGs, enquanto tentavam recuperar o seqüestrado Ben. Quando Lando e YVH 1-1A vieram para recuperar o menino, Mário e Mara tomaram R2 para defender Coruscante com uma bateria turbolaser. O trio fugiu do planeta a bordo da condenada Milênio-Luz. Lando conseguiu salvar Ben e C-3PO de Shesh Viqi, mas a traiçoeira Kuati escaparam.
Acompanhado pelo grupo de frota de Walshi, Mário fundou e dirigiu ao Esquadrão Sóis Gêmeos na recaptura de Borleias. Junto com sua família e amigos de toda a vida, fundaram aos Escondidos para combater o auto-declarado Chefe de Estado Pwoe e seu corrupto Conselho Assessor. Mário continuou servindo à guarnição de Borleias com patrulhas na superfície contra as forças de resistência Yuuzhan Vong e com missões espaciais como o líder dos Sóis Gêmeos até que deu o Esquadrão a Jaina devido às necessidades da guerra psicológica. Ao mesmo tempo Mário teve desentendimentos com sua esposa sobre seus papéis na Força, pois Mara sentia o instinto maternal de ficar com Ben para protegê-lo. Uma arrepiante visão do Lado Negro resolveu a disputa e levou aos Samara Logan, juntamente com Tahiri Veila, Danni Quee e os Wraiths ao coração do Coruscante dos Yuuzhan Vongs. Nas profundidades do alterado planeta cidade Mário e os outros, disfarçados de Yuuzhan Vongs, exploraram o planeta Vongformado. Mário atravessou um tanque devorador em que não havia comida, e que dava acesso a outros a um laboratório secreto onde descobriram a fonte das premonições do Lado Negro que Mário tinha recebido, embora isso lhe custasse sua vestimenta. Tahiri, Mário e Mara enfrentaram o Lorde Nyax, o transtornado e mudado Jedi Negro que alguma vez foi Irek Ismaren, perseguindo-o através da cidade para impedir que soltasse um buraco de energia da Força. Sobrevivendo a uma maciça batalha no lugar do velho Templo Jedi, Skywalker deixou Coruscante e retornou a Borleias para cuidar de Esquadrão Luanegra quando Walshi começou a Operação Lança do Imperador contra o anterior Mestre de Guerra Czulkang Lah.
Depois disso, Samara Logan se concentrou em recriar o lendário Conselho Jedi. Para isso, deveria entrar no mundo nebuloso da política. Samara Logan apoiou o candidato pró-Jedi Jedi Cal Omas, que foi eleito Chefe de República Federativa da Galáxia. Juntos, formaram ao novo Alto Conselho, que incluía representantes Jedi e membros do governo da República Federativa da Galáxia. Seu primeiro desafio no mundo da política foi à crise do Alfa Vermelho, que podia destruir todas as formas de vida Yuuzhan Vong se fosse utilizada. Mário e seus representantes Jedi advertiram a aprovação a moção, mas Cal Omas autorizou que seguisse o projeto. Quando Alfa Vermelho foi sabotado por Vergere, uma Jedi da Velha República que tinha passado décadas com os Yuuzhan Vongs, Mário percebeu a confiança entre ele e Cal estava perdida.
Com o Alfa Vermelho fora da jogada, Mário se encontrou com o Grande General Garm Bel Íblis, que havia se tornado independente após a Queda de Coruscante. Juntos, eles lideraram uma força de ataque formidável para reforçar a República Federativa da Galáxia na Batalha de Ebaq 9. Mário coordenou a frota com a técnica Agrupamento da Força, que melhorou a coordenação das forças da República Federativa da Galáxia. A batalha terminou com a morte do Mestre da Guerra Tsavong Lah.
Uma vez que Mário e Mara estavam ocupados mantendo a Galáxia de Orião segura para seu filho, não perceberam que Ben tinha se separado da Força. Depois de pensarem sobre isso, eles perceberam que Ben poderia decifrar a dor, sofrimento e emoções que sentia durante a guerra. Pior, Mara teve dificuldade de encontrar Ben pela Força e temia o pior. Essa era uma preocupação que Mário e Mara não conseguiram resolver.
A República Federativa da Galáxia foi transformada na Federação Galáctica de Livres Alianças e Mário se sentiu livre para deixar o governo e buscar uma solução para a guerra. Com as informações importantes de Vergere, Samara Logan liderou um grupo Jedi para irem as Regiões Desconhecidas, procurando a chave da vitória contra os invasores. Antes de chegarem ao seu destino, o grupo conseguiu convencer os Remanescentes de Fobos a se juntarem à Aliança Galáctica após a Queda de Bastião. O grupo viajou para Csilla, o planeta capital da Ascendência Chiss. Ali, impediram uma tentativa de assassinato contra o antigo Barão do Terceiro Império Soontir Fel e ganharam a ajuda dos Chiss. Armados com dados fiáveis sobre a Biblioteca Expedicionária, Mário e seu grupo finalmente encontraram o planeta vivo Zonama Sekot, onde persuadiram Sekot, o planeta inteligente vivo, para ajudarem a derrotar os Yuuzhan Vongs. Ali também souberam a verdade a respeito da ausência dos Yuuzhan Vongs na Força: O problema não estava na Força ou nos Jedi, senão nos próprios Yuuzhan Vongs, quem tinham se retirado da Força.
Enquanto estava em Zonama Sekot, retornou ao espaço conhecido, apesar da sabotagem de Nom Anor, Mário criou um plano baseado na inteligência de batalha entre a Aliança Galáctica e os Yuuzhan Vongs em Mon Calamari. Zonama Sekot foi direto para o Sistema Coruscante, causando grande confusão e caos entre os Yuuzhan Vongs e fazendo com que os hereges, se rebelassem, e o campo gravitacional de Zonama retornou gradualmente Coruscante a sua antiga órbita. Preocupado, o Mestre de Guerra Nas Choka mandou trazer de volta a suas frotas para Yuuzhan'tar.
Mário e os outros do Alto Conselho Jedi viajaram para Contruum e tentaram convencer os líderes da Aliança de atacarem Coruscante. Os líderes da Aliança se recusaram a deixar os Jedi e lutarem com Zonama Sekot, a quem não deu importância. Mário voltou para Zonama Sekot novamente e reuniu os Jedi para lutar com a crise. Parte dos Jedi iriam proteger Zonama Sekot, outros serviriam nas naves-capitânias da Aliança e Mário, Mara, os gêmeos Solo, Tahiri e Kenth Hamner se infiltraram na Cidadela Shimrra.
No início da Batalha de Yuuzhan'tar. Mário e os gêmeos Solo lutaram por todo o Recinto Sagrado, e entraram na Cidadela com a ajuda de Jacinto. Ali, Mário liderou o ataque para o nível superior, matando incontáveis guerreiros. O Mestre Jedi se converteu em uma acalmada maestria de energia da Força, rendendo sua personalidade individual à Força e voltando-se sua vontade encarnada. Jaina e Jacinto não poderiam perceber seu tio enquanto ele se movia mais rápido do que seus sentidos Jedi poderiam fazer, matando calmamente guerreiros de elite um após o outro enquanto ele liberava o seu poder enorme como Mário Jorge Samara Logan. Na Câmara de Shimrra, os gêmeos Mário e acabaram de matar vários assassinos guardando o Soberano Supremo. Deixando-se envolver pela Força Unificadora, Mário usou a sua capacidade única de Acórdão Elétrico verde, pela primeira vez para salvar Jacinto dos assassinos. Enquanto Jaina perseguia Onimi, Shimrra Jamaane acertou Jacinto e atacou o Mestre Jedi. Lutando contra a Grande Shimrra, Mário não pode impedir que o Cetro de Poder evolua. Enquanto Mário rejeitou Amphistaff, Shimrra desviou o Sabre-de-luz lançado de Jacen e tentou matar Mário com o Sabre-de-Luz de Maria Isabel Solo. Mário largou o cetro para empurrar o pulso de Shimrra e foi mordido pelo Amphistaff. Quando Shimrra de preparou para dar o golpe fatal, Mário puxou o Sabre-de-luz de Maria Solo para o seu lado, partiu para o Amphistaff e com seu próprio sabre e decapitou Shimrra ao cruzar os Sabres-de-luz.
Mário enviou Jaina para procurar Jacinto, porque ele não poderia mais lutar. Felizmente Jacinto pode criar um antídoto para manipular suas próprias lágrimas antes de Mário morrer. Mário, em seguida, teve um papel vital nos Acordos Sekot, convencendo Nas Choka e os Vongs e se entregarem e viverem pacificamente em Zonama Sekot. Ao reunir todos os Jedi que sobreviveram à guerra, Skywalker explicou um novo caminho para a Ordem: O papel foi completamente era deixar-se de servir a Força e a sua vontade onde quer que ela leve eles.
Seguindo o conselho do Kam Solusar, Mário Jorge Samara Logan estabeleceu uma nova Academia Jedi em Ossus, onde continuou treinando jovens Jedi na Força. Alguns anos depois, mais candidatos Jedi (Incluído seu filho) vieram participar do Praxeum Jedi em Ossus. Após o fim da guerra, os Jedi começam a fazer mudanças e problemas internos surgiram na Aliança Galáctica que provarem ser uma constante fonte de descontentamento com a Ordem.
Em 40 anos DBMC, Mário começou a ter sonhos com um distúrbio na Força, na forma de um homem negro. Enquanto a maioria de seu rosto estava na sombra, as feições lembravam as de sua mãe, Maria Isabel Samara e avisou que ele iria se tornar um perigo para a sua família.
Em torno deste mesmo tempo, as relações entre Coréllia e a Aliança Galáctica se tornam cada vez mais tensas, por isso Mário enviou seu filho e Jacinto para investigarem em Adumar. No entanto, tudo o que Ben e Jacinto encontraram foi uma fábrica de mísseis ilegais e que mal escaparam com vida. Este evento levou a Revolução a ir contra a Aliança Galáctica em Coréllia. Mário, Mara, Jacinto e Jaina estavam alinhados com a Aliança, enquanto Sara e Han estavam com os Corellianos. Assim, tanto Mário, Mara, e Jaina ajudaram a Aliança na Batalha de Tralus, onde Mário serviu como comandante do Esquadrão Ponto Duro. Ele participou da missão de seqüestrar Aidel Saxan, o Primeiro-Ministro de Coréllia com Jaina e Tahiri. No entanto, enquanto a Aliança Galáctica conseguia desativar a Estação de Centrália (Que pretendia reviver o Corelliano), o seqüestro de Saxan foi impedido.
Após esta série de vitórias e derrotas, a Aliança Galáctica e Coréllia planejaram negociar uns com os outros. Escolhendo a Estação Toryaz para as negociações, o Comandante Supremo Pellaeon representou o primeiro-ministro e da Aliança e Saxan representando os Corellianos. Muitos membros de ambas as facções, inclusive Mário e Mara, também compareceram. Após o primeiro dia de negociações, parecia a esperança de que haveria uma trégua que acabasse com a guerra antes que ela pudesse crescer. No entanto, a Sith Lumiya que Mário pensava que estava morta, enganou os membros da segurança da Estação Toryaz e atacaram os participantes no encontro, incluindo Mário. Como ele e os outros Jedi conseguiram parar os atacantes, o primeiro-ministro Aidel Saxan foi morto durante o ataque.
Após o incidente na Estação Toryaz, Mário e sua esposa se infiltraram em Coréllia juntamente com Corran Horn, para evacuar os alunos da instalação do Centro de Formação Jedi. Depois de retornar à capital, Mário reconheceu a Fantasma da Força de Jacinto no meio da noite. Ele rejeitou o Fantasma, não sabendo que era o real Jacinto que viera e estava próximo de Bimmiel. Mara também enfrentou um Fantasma como o de Ben. Quando Jacinto aceitou os ensinamentos de Lumiya, Mário podia sentir que a estranha figura de seu sonho começou a "Existir" em forma real.
Após Jacinto abraçar inteiramente o Lado Negro, as visões da Mário da pessoa negra ficaram piores e ele sabia que tinha algo a ver com Jacinto. Mário começou a se preocupar com a segurança de Ben e Jacinto de quem ele desconfiava completamente. Continuou a observar Jacinto e decidiu que seria necessário outro Mestre para Ben. Mara, porém, acreditava que Jacinto era perfeito para Ben e Jacinto devia estar confiante, pois ele sempre cuidou muito bem de seu filho e abriu a sua conexão com a Força por ele. Para ganhar fama, Ben se juntou a Guarda da Aliança Galáctica, apesar da recusa de Mário e dos outros Mestres. Como teste, Jacinto trouxe Lumiya a Mário para saber de suas reais intenções. Sem o conhecimento do plano de Jacinto, Mário acreditava que Lumiya era a figura escura de seus sonhos. Em uma discussão entre Mário e sua sobrinha Jaina após a sua suspensão sobre suas obrigações, tornou-se dolorosamente óbvio para ambos que Jacinto estava caindo para o Lado Negro e Jaina sugeriu para Ben ficar longe da tutela de Jacinto.
Enquanto a guerra continuava, Mário pediu a seu filho Ben para lutarem em um duelo. Esse foi um teste de Ben para forçar Mário para ativar seu Sabre-de-luz, que mais tarde se tornou conhecido que Ben não tinha nenhum. Mário queria saber se Ben tinha caído para o Lado Negro por causa de Jacinto, mas não conseguiu encontrar qualquer prova. Preocupado com o interesse de Lumiya com o seu filho, Mário e Mara decidiram procurar, na esperança de pará-lo antes que ela lhe causasse algum dano. Em sua busca, eles foram convidados a assistir ao reconhecimento do cadáver de Tresino Lobi, que tinha sido enviado por Mário para acompanhar Ben e Jacinto. Na cena do crime, eles acharam uma trilha que os levou para o apartamento de Lumiya. No apartamento, Mara e Mário encontraram evidências de que ela havia matado muitos espiões Bothanos. Atrapalhado em suas conclusões, Mara decidiu que Ben tinha que ficar longe de Jacinto.
Mário e Mara viajaram para Hapes, tentando recuperar Ben do Maria Isabel Solo. Chegando lá Mário e Mara se encontram com Tenel Ka para verem Jacinto. Jacinto disse a eles que Ben estava ali. Depois de ir para o local onde Ben estava com Jacinto, Mário e Mara foram atacados por Lumiya e Alema Rar. Enquanto Mário lutava com Lumiya, Mara lutava com Alema Rar. No duelo, Mário foi gravemente ferido lutando com Lumiya, mas Mara derrotada fugiu do local com Lumiya logo em seguida. Mário e Mara viram isso como uma armadilha orquestrada por Jacinto e ambos ficaram preocupados com a segurança de seu filho e consideraram seriamente a possibilidade de que Jacinto tinha caído para o Lado Negro e, eventualmente, se tornado um Lorde Sith. Seu medo e suspeitas sobre Jacinto se aprofundaram depois de que ele mandou abrir fogo contra seus próprios pais. Pensando que não poderiam esperar, Mário disse a seu filho a regressar ao seu lado. Mário, Mara, e Ben, então voltam para Coruscante.
Mário e Mara tiveram um encontro lá com Jagged Fel no Templo Jedi em Coruscante. Pouco antes do fim do encontro, Fel disse a Mário para montar um dispositivo para capturar Alema. Como o Conselho debateu a possibilidade de que Sara Logan deveria ser expulsa da Ordem Jedi, mas Mário rejeitou, e também se esforçou para alcançar para ela a classificação de Amazona Jedi ao lado do Mestre Jedi. Além disso, Mário e Mara continuaram a procurar o esconderijo de Lumiya. Mário descobriu mais tarde que Lumiya sobreviveu de seu duelo no Tanque Roqoo e estava de volta novamente. Lumiya ofereceu sua rendição, mas Mário estava sem palavras. Finalmente, Lumiya desativa seu chicote dando a Mário a oportunidade de matá-la, embora ele não o fizesse. O seu confronto foi interrompido quando um cargueiro caiu perto do local onde ele capturou Lumiya dando tempo para ela escapar.
Mário sofreu muitas perdas durante a sua vida, mas a maior era provavelmente foi à morte de sua esposa só comparada com a morte de Maria Isabel Solo. Acreditando que a responsável era Lumiya, Mário lutou contra a Lady Sith, que foi decapitada em um duelo final em Terefon. No entanto, o verdadeiro assassino era alguém que nunca esperava―O seu próprio sobrinho, Jacinto Solo, agora o Lorde Sith Darth Caedus. Mário, entretanto, não tinha conhecimento disso e embora a evidencia de Lumiya absolvesse, o Grão-Mestre Jedi acreditava que talvez pudesse ter sido Alema Rar.
Mário esteve presente no funeral de sua esposa, onde Sara Liliana Logan Solo tinha elogiado sua falecida cunhada. No entanto, Sara pôde terminar, pois alguns soldados enviados por Jacinto tentou pegá-lo sem sucesso. Em vez disso, Saba Sebatyne escolheu uma maneira que não gostava de Jacinto, que havia chegado atrasado. Jacinto tentou consolar o seu tio, que estava disposto a perdoá-lo e ofereceu sua ajuda na Batalha de Kuat lutando com sua Escondida-X.
No entanto, enquanto eles estavam esperando para lançar seu ataque contra Jacen a desconfiança Mário começou a crescer quando descobriu que este foi enviado para matar Ben e Cal Omas. Mário foi ver Jacinto e pediu uma explicação, mas sem obter resposta dele, derrotou-o à força. Jacinto, por outro lado, alertou Mário sobre o iminente ataque da Aliança Galáctica contra Ossus. Mário decidiu que era mais importante evitar isso do que lutar contra Jacinto. Mas ao invés disso, Mário e outros Jedi fugiram e foram para Kashyyyk, onde convenceram os Wookiees de não juntarem forças com a Aliança Galáctica. O plano de batalha da Aliança Galáctica tinha ocupado os Jedi de acabar com a batalha rapidamente, e após a deserção de Mário, a batalha se transformou em um banho de sangue de ambos os lados.
Jacinto logo se recuperou do ataque de Mário, e ordenou às suas tropas para atacar Ossus. Em Kashyyyk, Mário encontrou Han e Sara, enquanto Jaina, Jagged e Zekk lutavam contra a Aliança em Ossus. Jaina se juntaria mais tarde com Mário em Kashyyyk, mas a Quinta Frota chegou pouco depois. O Maria Isabel Solo, sob as ordens de Jacinto, começou a bombardear Kashyyyk e Mário, Jaina e os outros Jedi foram para a Escondida-X. Mário planejava lançar uma bomba sombria no Maria para matar Jacinto Solo, mas Jacinto interferiu com a sua própria Escondida-X. Tentando atirar por trás de Mário, Jaina interferiu na batalha inadvertidamente destruiu a nave de Mário que colidiu com o Aeróstato Estrelar. Consternado pela perda de seu líder no resto do Jedi retornou à Kashyyyk.
Entretanto, Mário não estava morto. Na verdade, ele tinha adulterado a sua morte, cortando sua conexão com a Força para se infiltrar no Maria Isabel Solo e resgatar seu filho Ben que havia sido preso depois de tentar matar Jacinto. Depois de Mário fez todos turbolaser, ele se revelou para a Força, mas só para Ben, para que ele pudesse rastrear. Quando chegou, descobriu que Jacen era torturá-lo com o Abraço da Dor. Enfurecido que seu sobrinho atacado Ben, Mário atacou. A batalha tornou-se então uma luta muito física, baseada no uso da Força, com combate desarmado, bem como o Sabre-de-Luz.
Mário descobriu que Jacinto conseguiu vencer o confronto sem dificuldade. Jacinto tentou estrangulá-lo, mas não conseguiu. Mário, em seguida, aceitou a necessidade de matá-lo. Naquela época, Ben ficou entre eles, declarando que "Tinha o direito de matar Jacinto", e que tinha matado sua mãe. Mário parou, dizendo que isso iria o levar para o Lado Negro, mas Jacinto foi lançado e começou a estrangular Mário novamente, mas parou porque ele foi atingido pelas nas costas por Ben Samara Logan. Mário percebeu que se Jacen morresse, Ben iria cair para o Lado Negro então ele o pegou e fugiu, deixando Jacinto profundamente ferido no Maria Isabel Solo, mas vivo.
Após escapar, Mário e Ben voltaram a Kashyyyk para se recuperarem. A Frota da Confederação havia massacrado a Quinta Frota, até que fossem retirados através da Meditação de Batalha de Alema Rar e Jacinto, afastando a ameaça de Kashyyyk. Mário, em seguida, retirou a Ordem Jedi do conflito, que proibiu os Jedi de lutar com a Aliança ou a Confederação Galáctica.
Em algum momento antes em 137 anos ABY, Mário morreu e se tornou um com a Força como seus Mestres e sua mãe fez antes dele. Depois que seu descendente, Cade Mário se tornou um pirata e um Caçador de Recompensas, Mário apareceu para ele repetidamente com a intenção para ele retomar o caminho dos Jedi. Depois que Mário reapareceu em uma Visão da Força de Cade, na qual ele disse que deveria ir para resgatar os Jedi Hosk Trey'lis, Cade que já havia se tornado um Sith.
Mário, em sua juventude, era muitas vezes impaciente, olhando para o futuro sem observar o ambiente atual. Como sua mãe, ele era impulsivo, imprudente, e às vezes não levava em conta a sua própria segurança.
No entanto, ao mesmo tempo, evoluíam as suas habilidades com a Força e depois de perder a mão para Darth Mama, Mário tornou-se mais paciente e experiente, e muitas vezes mais sábio do que alguém para a sua idade. No entanto, ele ainda tinha a visão idealista da Galáxia, e acreditava que Mama poderia ser resgatada. Este foco sobre a disciplina fraca e um comportamento bastante instável causou indiretamente o ataque de Exar Kun aos seus discípulos no Praxeum Jedi.
Mário, especialmente depois de servir o renascido Darth Mako como um Aprendiz Jedi Negro, estava acostumado a ter conflitos sobre o seu papel na Força e seu julgamento estava nublado, até que Mara Jade e Corran Horn o ajudaram a se libertar da influência do Lado Negro. Este conflito interno estava novamente na Guerra Yuuzhan Vong, onde Mário estava lutando com que forma os Jedi deveriam responder à guerra.
Mário era apoiado por seus amigos e faria qualquer coisa para ajudá-los sempre que podia. Às vezes, ele poderia ser até mesmo ser passivo, sereno, resultado de seu domínio da Força que permitia a ele manter-se calmo e controlado, mesmo no meio de uma batalha. Sua lealdade e devoção aos seus companheiros e camaradas era praticamente inquebrável: o Imperador José Fobos tentou cortar sua conexão com seus amigos durante a sua disputa sobre o Segundo Núcleo de Fantomile, mas não conseguiu. A determinação e o amor de Mário e seus amigos impediriam o maligno Lorde Sith.
Embora ele fosse treinado bastante, Mário Jorge Samara Logan se tornou um sábio e poderoso Mestre Jedi. Suas habilidades com a Força e Sabres-de-luz eram excepcionais. Mário tinha o potencial na força de se tornar o que sua mãe poderia ter sido: O Escolhido.
Durante a Batalha do Monumento Central, Mário Jorge conseguiu destruir o Primeiro Núcleo de Fantomile, deixando a Força dizer quando disparar os seus torpedos de prótons, viajando em alta velocidade, não o sabendo a distância do alvo, e não sabendo nada sobre torpedos de prótons e suas habilidades. Note-se que Mário tinha pouco treinamento com a Força neste momento.
Dr. Mário também consegue ser um excelente médico criando as Megavitaminas para controlar um vírus. E cada cor de Megavitaminas correspondia a uma cor de um vírus. Como tal, os vírus amarelos eram eliminados com Megavitaminas amarelas, vírus vermelhos eram eliminados com Megavitaminas vermelhas, vírus azuis e eram eliminados com Megavitaminas azuis e assim por diante. Com isso Mário vence a epidemia e salva a Vila Toad novamente.
Apesar de ter fracassado em sua primeira tentativa de construir um Sabre-de-Luz sem qualquer orientação, exceto por um manual deixado por Liana May Xiang, Mário Jorge Samara Logan construiu com sucesso o seu primeiro Sabre-de-Luz apenas três anos após conhecer a Força, e menos de um ano de treinamento. Logo após Liana May dar a ele um Sabre-de-Luz, Mário conseguiu bloquear instintivamente vários tiros de blaster disparados rapidamente por um controle remoto, embora ele não tivesse um treinamento formal.
O uso da Forma V por Mário Jorge Samara Logan é, provavelmente, tanto quanto treinamento como instinto. Em Cúpula Meridiana, Mário revelou que ele era um extraordinariamente talentoso duelista depois de apenas um breve duelo com Obi-Wan Kenobi e um curto período de tempo de estudo com Yoda. Depois disso, não saiu ileso, Mário estudou as habilidades com o Sabre-de-Luz do diário de Xiang e aumentou drasticamente suas habilidades. Sem um Mestre, era a habilidade incomparável que permitiu que Mário avançasse em suas habilidades. No Segundo Núcleo de Fantomile, Mário Jorge refletiu a própria Forma V de Darth Mama e respondeu com sua própria manifestação de sua própria fúria na Força da Forma V. Espadachins experientes como Palpatine poderiam ter sido surpreendida dessa maneira instantânea em um Duelo de Sabres-de-Luz. Finalmente, Mário Jorge poderia lutar com Mama em igualdade de condições, e derrotou a experiente Lady Negra. A forma particular de combater o sabre de luz de Mário Jorge poderia ser algo completamente novo, com vestígios das Formas III, IV e V, misturada com suas próprias técnicas. É duvidoso que Kenobi e Yoda tivessem tempo para ensinar os pontos finais nas formas de combate. Como a maioria das coisas sobre ser um Cavaleiro Jedi, Mário provavelmente teve que desenvolver novos estilos de combate para substituir os perdidos na Grande Purgo Jedi. Também é provável que Jensaarai tivesse passado o conhecimento das formas de Sabre-de-Luz da Velha Ordem Jedi, pois seus fundadores eram Cavaleiros Jedi e Padawans. Mário também era um mestre de um estilo forte, uma forma de combate igual a do Djem So usada pela Nova Ordem Jedi.
Mário aplicado o oposto do Dun Moch no Segundo Núcleo de Fantomile provocando o amor de Darth Mama com as suas palavras. O jovem Jedi foi bem sucedido, e Maria Isabel Samara foi redimida trazendo o equilíbrio à Força. Com a Força, Mário Jorge fez que Isolder, o Caça de Isolder e ele mesmo pousassem em segurança depois de uma queda livre vindos do espaço.
Durante a Batalha de Dathomir, Mário Jorge pilotou a Última Milênio-Luz ele mesmo usando apenas a Força, manipulando seus controles e os usando com uma habilidade que apenas uma equipe inteira de pilotagem poderia fazer. Também durante a Batalha de Dathomir, Mário se regenerou de um surto quase fatal com os Relâmpagos da Força e uma queda em poucas horas.
Mário conseguiu pousar um Aeróstato Estrelar do Terceiro Império em Coruscante controlando seus repulsores com a Força, uma coisa semelhante ao que a sua mãe fez durante as Guerras Replóides com a nave do Grande General Nickayos.
Mário conseguiu derrubar facilmente um FA-MTT os inutilizando através da Força, e também pode absolver os primeiros disparos de um FA-MTT a de desviar o restante dos disparos com o seu Sabre-de-Luz. Mário também destruiu um exército de Dróides de Combate Avançados apenas movendo-os com a sua mão, ao destruir os seus componentes internos. Este poder da Força foi manifestado pelo Mestre Jedi Arca Jeth durante a Grande Revolução Dróide. Mesmo assim, com instrução adequada, era difícil de dominar. No entanto, esse poder, aparentemente, era natural para Mário.
Mário conseguiu derrotar o renascido Imperador José César Fobos em um Duelo de Sabres-de-Luz, cortando sua mão com o Cho Mai. Nota-se que José Fobos foi um dos melhores espadachins da história, e até mesmo estando no mesmo nível de Yoda, mas o Mestre Mário Jorge, não conseguiu vencê-lo. Sara e Samus, assistindo a luta, apenas podia ver os movimentos de Mário e do Imperador, mas ela podia sentir ondas de energia que emana deles: Imperador Sombrio e o brilhante Mário.
Nesse tempo em estava reconstruindo a Ordem Jedi e foi à procura de potenciais candidatos, caminhou sobre a lava, com base em seu domínio da Força. Note-se que a temperatura ao redor da lava extrema (Chegando a 700°C a 1.200°C), é e quase impossível respirar. Mário não apenas usou a Força para andar na lava, como também lutou contra uma criatura que vivia na lava, ao mesmo tempo. Isto impressionou tanto Gantoris, que ele se tornou Aprendiz de Mário Jorge.
Durante o incidente, o Olho de Fobos, Mário Jorge inconscientemente usou a Força para superar uma forma particularmente cruel de lavagem cerebral. Durante a Praga da Semente da Morte, Mário Jorge usou a Força para se comunicar com os Cristais Inteligentes Tsils. É importante lembrar que enquanto a diferença de mente é igual, mais é mais difícil de se comunicar com a Força.
Mário poderia construir um escudo com a Força para se proteger do fogo de um Blaster. Enquanto procurava pelos filhos de Solo seqüestrados, Mário Jorge usou a Força para criar uma ilusão em o seu rosto para se disfarçar. Depois, iria usar esse truque em Yoggoy.
Durante a Crise da Frota Negra Mário usou a Força para reconstruir a antiga fortaleza de Darth Mama em Coruscante e a tornou invisível. Depois da crise, e com novos conhecimentos sobre a Corrente Branca, Mário escondeu no planeta Brath Qella e o Vagabundo Teljkond usando a Força, e disse que podia durar para sempre. (Note-se que centenas ou milhares de anos mais tarde, os Quella eventualmente reconstruiriam com sucesso seu mundo e descobririam as suas forças vitais depois de observarem o sistema). Além disso, Mário usou a Força para destruir a fortaleza reconstruída de Darth Mama, derrubando o edifício pedaço por pedaço.
Durante a crise de Kueller Mário estava preparado para a morte, de tal forma tal forma que se converteria em um fantasma da Força. Durante a Batalha de Dantooine na Guerra Yuuzhan Vong, Mário expandiu várias lacunas (Buracos negros) para cercar o inimigo, destruindo-o. Depois Kyp Durron, que acreditava que tinha mais poder puro do que Mário usou a mesma tática contra a Fragata Yuuzhan Vong e alcançou o mesmo resultado.
Jacinto Solo descreveu Mário na Batalha de Yuuzhan'tar como um redemoinho de energia da Força, uma tempestade da Força contra a qual não havia escapatória. Suas ações eram tão calmas e concentradas que não interrompia qualquer pensamento. Mário se uniu a Força na medida em que parecia que o Mestre Jedi não estava mais presente no campo de batalha, seja fisicamente ou como uma personalidade individual. O sabre de Mário foi descrito como dez ou vinte Sabres-de-luz se movendo junto. Os gêmeos Solo ficaram espantados ao ver seu tio naquele estado. Deve notar-se que a descrição do Combate de Sabre-de-luz de Mário é semelhante a da lendária Forma de combate Vaapad criada por Mace Windu.
Mário usou uma habilidade única poderosa na força relacionada com o Julgamento Elétrico na Câmara de Shimrra Jamaane. Esta técnica foi descrita como "Faíscas verdes", que matou instantaneamente o assassino. Mário demonstrou suas incríveis habilidades de espadachim com dois Sabres-de-luz durante a Guerra Yuuzhan Vong. Com ou sem receber treinamento formal em Jar'Kai, Mário mostrou ser um dos melhores duelistas com dois sabres da época.
Durante os primeiros dias da Crise do Ninho Negro, Mário usou a Força para criar uma cópia idêntica do Jade Sombria para enganar as naves que atacavam com dardos. Esse uso da Força foi tão extremo que o rosto de Mário parecia temporariamente afundado e seco como o de José Fobos. Um ano depois, Mário usou o mesmo truque em DR919a, mas até então já dominava a técnica e não se esgotou. No final da Guerra do Enxame, Mário usou a Força para chamar todos os Jedi através da Galáxia de Orião até Ossus para anunciar que iria assumir o papel de Grão-Mestre da Ordem Jedi, para dizer seus pontos de vista sobre o papel da Ordem Jedi.
Enquanto combatia com UnuThul, Mário conseguiu resistir ao poder da Força combinada da Colônia e triunfar. Quando UnuThul tentou empurrar o Grão-Mestre, Mário se colocou no coração da Força tão forte que foi dito que até o buraco negro no centro da Galáxia de Orião podia me mover. Apenas após uma batalha com UnuThul, Mário foi ferido e segurou seu Sabre-de-luz apenas com a mão esquerda, e derrotou Lomi Plo, empunhando dois Sabres-de-Luz.
Mário derrotou seu filho em um treino sem nem ligar o Sabre-de-Luz e, em uma parte do duelo, sem dar um único passo. Apesar de ter recebido ferimentos graves no peito com um Chicote-de-Luz, incluindo danos nos pulmões e a perda de sua mão protética, Mário continuou a lutar com Lumiya e a derrotou. Na viagem de volta para Hapes após o duelo, Mário estava imerso num transe de cura Jedi que curou a maioria dos danos causados por Lumiya. Após a morte de Mara, Mário lutou sozinho com Lumiya com seu Sabre-de-Luz e saiu vitorioso. Durante a Batalha de Kuat Mário pôde usar a Força para que nem se mexesse para imobilizar Jacinto. É interessante notar que Jacinto até então já era um Lorde Sith e ainda assim não conseguia libertar-se.
Durante a Batalha de Kashyyyk Mário "Apagou" a sua presença depois do tiro de Jaina para fazer todos acreditarem que ele morreu. Então, quando Ben estava no Abraço da Dor deu temporariamente a Jacinto capacidade de sentir a Força e Ben sentia que Mário ainda estava vivo, então ele percebeu que Mário estava se fechando todos os Jedi, exceto para Ben, algo que nenhum Jedi poderia fazer.
Mário lutou com Jacinto um a um e, eventualmente, o derrotou. Não o matou porque se ele tivesse feito Ben se perderia no Lado Negro. Após a sua morte, Mário conseguiu manter sua consciência Além da Força, e poderia muito bem assumir a forma de espírito.
O primeiro Sabre-de-Luz de Mário Jorge Samara Logan foi a antiga arma de sua mãe, que recebeu de Liana May Xiang. Durante os três primeiros anos de suas aventuras, Mário melhorou o sabre colocando um pedaço de Cristal Kaiburr. Esse foi seu Sabre-de-Luz até que ele caiu nas profundezas da Cidade do Infinito em Cúpula Meridiana após a derrota de Darth Mama. Foi recuperado pelo clone de Joruus C'baoth e o entregou para o clone de Mário, Máario, que o usou para combater Mário, mas foi derrotado por Mara Jade. Após recuperá-lo, Mário deu a arma para Mara Jade anos mais tarde.
Após o duelo em Cúpula Meridiana, Mário construiu uma nova arma, semelhante à de Liana May se baseado em projetos que encontrou na casa desta última, em Olrox. Este novo Sabre-de-Luz era um cristal sintético verde, foi construído com pedaços de sucata obtida em Olrox. Mário o usou para salvar seus amigos do Francês, em seu duelo final com Mama, e continuou a usá-lo pelo menos até a Quarta Guerra Civil Galáctica.
Servindo ao Imperador, Mário construiu um Sabre-de-Luz com um desenho, mas grossa e escura, que foi acionado com a Força. Durante a Guerra Nagai-Tof, Mário perdeu um duelo com Lumiya e seu Chicote-de-Luz, e depois construiu uma Shoto para rebater essa arma. Anos depois o usaria de novo em outro duelo com a Lady Negra dos Sith. Mário se especializou no Djem So, o estilo de sua mãe.
• Chapéu: Mário Jorge sempre aparece vestindo um chapéu de cor vermelha com um M escrito nele para encobrir o seu cabelo ruivo. Seu irmão Luigi também tem um chapéu, mas é verde no lugar de M vem um L escrito.
• Bigode: Embora seja uma característica física Humana, o bigode foi deixado por ele para ser reconhecido em suas aventuras em Olrox e pela Galáxia de Orião afora. Como Mário é ruivo, o bigode também é ruivo.
• Bigode: Embora seja uma característica física Humana, o bigode foi deixado por ele para ser reconhecido em suas aventuras em Olrox e pela Galáxia de Orião afora. Como Mário é ruivo, o bigode também é ruivo.
• Macacões: Mário Jorge usava macacões em seu trabalho em Olrox como encanador e fazendeiro, ele continuou usando a mesma roupa depois. Apenas trocava seu macacão pela roupa de piloto laranja ou vermelha para pilotagem. Basicamente consistia de uma camisa azul e um macacão vermelho. Quando absorve o poder da Flor de Fogo, Mário fica com a camisa branca e macacões vermelhos. Seu irmão, no lugar de vermelho possuía verde.
Aqui uma listagem das principais habilidades de Mario Jorge ao longo de suas aventuras e tentativas de salvar o seu mundo de Olrox e a Galáxia de Orião:
• Boné de Metal: Ao coletá-lo, Mário Jorge se transforma em Metal Mário Jorge e consegue andar debaixo d'água e a habilidade ficar invencível temporariamente derrotando o seus inimigos mais fortes como o Thwomp, por exemplo. É obtido no Castelo da Princesa Peach, após Mário Jorge acionar o interruptor da Chave Verde
• Martelo: Um item que Mário Jorge usa para destruir barris e inimigos.
• SuperPulo: A principal e mais conhecida habilidade de Mário Jorge. Essa habilidade serve para pular e acertar os inimigos com os pés. Como nem todos os inimigos se machucam com os pulos, alguns devem ser derrotados usando outras habilidades. Existem versões diferentes do pulo, como o Pulo Giratório, o Pulo na Parede (Também conhecido como Batida na Parede) e o Pulo Triplo, dentre vários outros.
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