Mas havia muitos interesses comerciais em jogo e muitas empresas e sistemas planetários começaram a formar um grupo separatista que procurou por armas contornar as leis da República, espalhando ideais de separatismo por vários sistemas estrelares, incluindo Ando e Sy Myth e terminando em um êxodo maciço de Aqualishs e myrthianos de Coruscante. Este grupo conhecido como a Confederação de Sistemas Independentes teve incluso nas suas fileiras a Federação do Comércio, cuja terra natal era Neimoidia e mundos empresariais e incluía uma fábrica de Dróides de Combate em Geonosis, as Associações de Comércio nativas das colônias Castell em FelúCia, a União Tecnológica que tinha sob seu controle fazendas em Saleucami e indústrias em Mustafar e por último, o Clã-Bancário Intergaláctico de Mygeeto e Muunlinste, bem como o poderoso Conde Dooku (Um Mestre Jedi) e o temível General Grievous.
Com a Crise Separatista iminente, a Confederação de Sistemas Independentes passou a ser uma ameaça visível à República. Para acabar com a Confederação, o novo Supremo Chanceler usou os Cavaleiros Jedi e um Exército de Clones que tinha sido criado em segredo pelos clonadores Kaminoanos da Velha República, eles disseram, encomendado pelo Mestre Jedi Zaifo-Dias. O conflito entre a República Galáctica e a Confederação de Sistemas Independentes foi chamado de Guerras Clônicas e na maioria dos combates, Coruscante era o alvo. Foi o alvo de terrorismo e assassinatos de líderes da República, incluindo o seqüestro do Senador Meena Tills por terroristas de Kurenai em 22 anos ABY (Que na verdade era uma fachada para uma tentativa de voltar o Setor Empresarial contra a República). Em 21 anos ABY viu-se uma onda de grandes catástrofes, incluindo o Subjugo de Coruscante e os assassinatos dos Senadores Finis Valorum e Viento.
Embora Coruscante não tenha sofrido efeitos das Guerras Clônicas, o planeta era usado para desfiles das Tropas Clone. Mais medidas foram tomadas por Palpatine para a "Segurança de todos", mas na verdade estava adquirindo mais Poderes Emergenciais. Foi nessa época que foi formada a CPNO, uma organização xenofóbica e anti-alienígena que os acusava várias espécies e raças de terem provocado a guerra por sua incompetência. O Senado nomeou o Vice-Almirante Terrinald para ocupar o Sistema de Defesa Planetário. Em 19 anos ABY, a Confederação lançou um Assalto surpresa em Coruscante. Usando rotas hiperespaciais secretas através do Núcleo Profundo fornecidas por Darth Sidious, a Frota Separatista sob o comando do temível General Grievous executou um ataque no planeta. Enquanto a Frota da República lutava contra a Frota Separatista na atmosfera superior, um exército de Dróides de Combate desembarcou na Cidade Galáctica. A invasão distraiu as forças Jedi e clone fazendo com que o General Grievous e seu Esquadrão de Magna-Guardas capturassem o Supremo Chanceler Palpatine. No entanto, Anakin Skywalker e Obi-Wan Kenobi conseguiram resgatá-lo da infame Nave Mão Invisível. A Segunda Batalha de Coruscante acabou resultando em favor da República e o Exército Separatista foi forçado a fazer uma retirada completa.
Quando a República caiu e Palpatine iniciou a Declaração de uma Nova Ordem no Senado Galáctico que oficializou a criação do Império Galáctico. O Imperador renomeou Coruscante como o Centro Imperial e a Cidade Galáctica foi renomeada também como a Cidade Imperial. As espécies não-humanas foram obrigadas a viver nas partes segregadas (Conhecidas como os "Bairros étnicos ") da Cidade Imperial, tais como Invisec. O ganancioso Imperador começou a reformular Coruscante com seus próprios projetos, incluindo a prestação de vigilância nos milhares de sistemas em turno do planeta. Grandes geradores de escudo foram colocados em toda a Coruscante, e onde foram colocados, ocorreram severas tempestades, dando ao planeta um olhar mais gótico, que espelhasse o desespero total de muitos de seus habitantes enquanto dificultava sob a ordem de ferro de Palpatine.
O Imperador também reconstruiu o Palácio da República e o renomeou Palácio Imperial, um dos maiores edifícios já feitos na Galáxia. Coruscante era uma fortaleza inexpugnável, com centenas de Stormtropas, andadores e guerreiros altamente treinados. Outras estruturas da República, como o Senado Galáctico e o Templo Jedi, foram isoladas e fechadas. Em 161 anos ABMC, quando a Aliança para a Restauração da República pós um fim a Palpatine e o seu governo na Batalha de Endor, houve uma insurreição entre a população de Coruscante. Os cidadãos comemoraram a morte de Palpatine com fogos de artifício e derrubando suas estátuas. Esta insurreição foi esmagada pelos Stormtropas com ordens de Ysanne Isard.
Após a morte de Palpatine, uma série dos Senhores da Guerra do Imperador, incluindo Isard, governaram o Centro Imperial. O Centro Imperial embora seu reinado fosse atormentado por ameaças de Senhores da Guerra rivais e a expansão da Nova República. Antes que ela fugisse do Centro Imperial, contaminou a fonte de água da cidade com o vírus mortal Krytos, que afetou somente as espécies não-humanas. Eventualmente, a Nova República destruiu o vírus e libertou o Centro Imperial, retornando o seu antigo nome Coruscante. Isard usou seu Super Destróier escondido para fugir, matando milhões nesse processo, destruindo uma grande parte da paisagem da cidade e lançando na orbita uma Skyhook, antes de saltar para o hiperespaço.
Eventualmente a Nova República reconstruiu a Cidade Galáctica e fez de Coruscante outra vez o planeta para seu governo. Durante esses anos, Arwen Organa Neon teve aqui o seu filho, Tomé Gabriel Logan. O pai de Tomé era o agora Rei de Gondor, Guilherme Aragorn Logan. Aqui também se deu um quase ataque liderado pelo ressuscitado Naga Sadow e seu servo Henrique Lensherr (Um dos corpos clones de Palpatine, renascido no planeta Byss). Naga Sadow foi ressuscitado através de Magia Sith usando o sangue de Sofia Samara. Foi nessa época também que a Galáxia de Órion testemunhou o nascimento de "A Escolhida" no planeta maravilhoso de Kubanacam. Coruscante foi atacado por Naga Sadow em 158 anos ABMC e libertado neste mesmo ano pela Nova República. Quando uma Cura para as células "Midi-chlorianas" dos usuários e Mutantes da Força é descoberta em um Mutante de Romano. Todos os Mutantes se revoltam, e armam com Naga Sadow invadir Romano. Durante a chamada Batalha de Romano, Naga Sadow e Lensherr reuniram Mutantes, Orcos, Koopas, Stormtropas para um ataque a Base da cura em Romano. Kimberly Grey s ajuda no final, mas esta e Naga Sadow são derrotadas por Aragorn Logan, Sofia Samara, Lucas Skywalker, Arwen Logan e a filha de Sofia: Maria Samara. Com o Império e seus remanescentes todos derrotados, este se rende a Nova República.
No entanto, uma organização liderada pelo General Miguel Bisão, líder da Shadaloo (Organização de cunho Imperial criminosa) cria atentados terroristas em vários lugares, os Jedi e Mutantes são chamados para combatê-la. No início, Bisão tentou fazer com que a Shadaloo lançasse ataques terroristas coordenados. Mas após a descoberta de sua Base secreta em Yavin IV e a Lua de Miranda, perceberam que Bisão e sua organização estavam manipulando o cenário para permitir que as espécies Zaioonianas e Orcas invadissem o planeta Naboo. A Rainha de Naboo, Éoym Trautman (Sucessora do Rei Theóden) fugiu para Coruscante para resolver a crise em seu planeta. Ela decide que o Senado Galáctico da Nova República eleja como Governador Eric Lensherr de Naboo. No entanto, o que ninguém sabia era que Lensherr era quem liderava Bisão e criou toda a crise para ele mesmo ser ele eleito Governador da Galáxia de Órion. Bisão voltaria três anos depois para aterrorizar a Galáxia.
A Shadaloo e a recém criada Aliança Zaiooniana juntamente com a União Koopa pregavam que a Nova República havia se tornado assim como o Império Galáctico, um governo corrupto e ineficiente. Bisão conseguiu a atrair a atenção do líder da Aliança Zaiooniana, o Comandante Rsyss em uma reunião no planeta Zaion, fora dos limites da Nova República. Eles queriam formar um governo com autonomia própria para governar um espaço da Galáxia, mas a Nova República não deixava. Eles então começaram a chamar vários sistemas e planeta para a causa comoMordor e Cybertron. Após isso, a Shadaloo passou a ser uma ameaça real aos olhos da Nova República assim como foi o Império uma vez. Um atentado quase matando a Rainha Éoyn faz aas primas e Mestras Jedi Sofia e Lulu Samara se unirem. Sofia descobre um Exército criado de clones no planeta Halo. Neste planeta habitado pelos Kaminoanos emigrantes de Kamino, Sofia luta contra Akuma Feet. Uma Caçadora de Recompensas e a segue em direção a Zaion.
Em Zion, o Alto Conselho Jedi envia as Halotropas para iniciar o que seria chamada de a Batalha de Zaion. Onde Yoda e Lucas resgatam Lulu, Samara e Sofia em cativeiro por Bisão. Essas Halotropas foram aprovadas após o Governador Lensherr receber poderes emergências para a guerra. Akuma Feet morre e Bisão escapa. A Galáxia se vê novamente envolvida em um conflito conhecido como as Guerras Predatônicas. Após quase um ano de conflito. Lensherr propõe as leis marciais para conter a revolta em Coruscante. Ainda foi criada a CPNVO, que excluía alienígenas das leis racistas e xenofóbicas. Mais tarde Lensherr é seqüestrado em um ataque feito por Rsyss e Bisão, mas totalmente orquestrado por Lensherr para fazê-lo parecer inocente. O ataque dos Zaioonianos não destrói alvos-chaves como o Senado ou o Templo Jedi. Vários Jedi, Mutantes e Halotropas perderam suas vidas nesta Batalha de Coruscante. Mas apesar disto, Bisão foi morto por Lulu Samara restando apenas Rsyss no comando da Shadaloo e da Aliança Zaiooniana. O Exército inimigo retirou-se completamente.
Horas após a morte de Rsyss por Lucas Skywalker, Lulu Samara traiu os Jedi e se alia a Lensherr que se revela um Lorde Sith. Eles executam a Ordem 99 que ordena a todos as Halotropas atacarem os Jedi e Mutantes também pela Galáxia a fora. Dos muitos Mutantes e Jedi, todos morrem restando apenas algumas centenas incluindo Sofia Samara, Aragorn Logan, Arwen Organa e Lucas Skywalker. Fobos também funda o Segundo Império Galáctico sob o pretexto de paz e de acabar com a corrupção e a guerra. Lulu Samara, agora com o nome de Darth Connie mata todos os membros da Shadaloo e da Aliança Zaiooniana restantes em Mustafar. Sofia também morre nos braços da filha Maria Isabel Samara.
Durante o reinado de Lensherr como o Governador da Galáxia e Imperador do Segundo Império Galáctico. A Novíssima Ordem tinha um programa que renomeava os setores de Coruscante assim como no Império de Palpatine. Coruscante em si foi chamado de Centro do Segundo Império, o Setor Coruscante, Setor do Segundo Império. Lensherr reformou o Palácio Imperial e o renomeou como Palácio do Segundo Império. O Templo Jedi foi cercado e o Sendo foi dissolvido durante a Batalha de Zaion. Após a Batalha de Aspene e as mortes de Lensherr e Connie, As pessoas saíram para comemorar tal fato, mas a multidão foi brutalmente dispersa por Halotropas comandas por Cuttler Beckett. Beckett também se tornou o Imperador interino até a sua morte durante a Batalha no Redemoinho de Calypso. Beckett também perseguiu Maria Samara e Tomé Gabriel. Seu erro foi de confrontar diretamente o Almirante Lorde Sith Dav' Jones, um dos líderes da União Koopa que também morreu em combate. Durante este tempo também foi formada a HYDRA.
Coruscante foi retomada pela Novíssima República pouco tempo antes da Segunda Guerra Civil Valdendiana. Neste tempo foram fundados os Ultranacionalistas Valdendianos e o grupo Batom Negro, como também o grupo Rajada na Escuridão. Eles estavam lutando por causa da Energia Sol Negro (Esta energia se tornou uma das energias mais poderosas da Galáxia, pois era extraída de qualquer lugar com Sóis, basicamente ele guardava toda a energia do ambiente em um depósito de energia chamado de Reator Mako ou Reator Solar). Coruscante foi quase destruído mais tarde, mas foi impedida por Surfista Prateado e mais um grupo que salvaram o planeta. Em algum momento o planeta Gondor é bloqueado e logo em seguida atacado pela União Koopa, o que faz o líder do planeta Tomé Gabriel ir até Coruscante. A crise, no entanto, retirou o Supremo Chanceler Severino Cavalcanti do poder apenas para ser substituído por José Fobos entrando prometendo acabar com a corrupção e desmilitarizar a União Koopa. A União Koopa e o Rajada na Escuridão criam atritos com a Novíssima República.
Em algum momento da História, Maria se casa com Tomé em segredo e vem morar em Coruscante junto com ele. Eles têm vários filhos escondidos como Mário Jorge, Luigi Logan, Samus Aramovich, Sara Liliana, Mileena Nayame, Rock Logan, Jeffrey Goku Samara Logan, Artur Link e Ash Samara Logan. Todos nascidos em Coruscante. Em 135 anos ABMC, o grupo terrorista Rajada na Escuridão começou a desunir os sistemas planetários da Novíssima República. Durante esse tempo, vários lideres da Novíssima República foram vítimas de ataques terroristas, inclusive o Senador Tomé Gabriel Logan em um atentado a sua nave. Ele sobreviveu, seus ajudantes morreram. Maria Samara e Liana May ficaram como seus guarda-costas, assim elas perseguiram um Caçador de Recompensas por Coruscante até que ele fosse morto por Surfista Planeado, o que fez Liana ir para Kamino apos uma informação dada a ela por Nuano Trupane. A jóia da Galáxia de Órion de sempre foi suprimida uma vez que foram concedidos Poderes Emergenciais ao Supremo Chanceler José César Fobos, usando Coruscante como ponto de início para as Guerras Replóides, para uma tentativa de resgate para Liana em Koopan, o centro do Rajada na Escuridão. As grandes legiões de Tropas Replóides foram abrigadas nos grandes transportes da Novíssima República ao redor do planeta, tornando a megalópole por dentro um dos últimos maiores centros de bases militares da Galáxia. Coruscante foi alvo de terrorismo neste tempo incluindo a morte de Severino Cavalcanti, a Noite dos Longos Punhais e o Massacre da Confederação, alguns planejados por terroristas de Kurenai.
Embora a população de Coruscante não sofresse com os horrores das Guerras Replóides, tais incidentes serviram de pretexto para incluir inúmeras mudanças de Fobos em Coruscante em prol de uma "Maior segurança". Grandes áreas da cidade foram transformadas em plataformas militares e os Exércitos Replóides foram enviados para todas as partes da Galáxia de Órion. Neste planeta ainda foram editadas as primeiras leis racistas e xenófobas do período do governo de Fobos, dentre as quais as leis de "Pureza" da "Alta Cultura Humana, Orc e Koopa" conhecidas como as Leis de Coruscante. Foram esses grupos que fundaram a Juventude Fobosista e a CPTO. Foram feitas passeatas e desfiles patrióticos. Um prefeito se vangloriava que durante Noite dos Cristais, 28 cidadãos alienígenas morreram. Outro triste fato de Coruscante foi à retirada de bens de alienígenas: Diversos moradores de Coruscante foram forçados a vender empresas e propriedades. Alguns até enviados a Campos de Concentração ou se juntaram ao grupo Rajada na Escuridão.
Este planeta foi alvo do grupo terrorista Rajada na Escuridão durante as Guerras Replóides em 132 anos ABMC, e quase caiu sob o seu poder. O malvado Grande General Nickayos ordenou a guerra pessoalmente, sob o comando do Lorde Sith, Darth Mako, a fim de raptar o Supremo Chanceler José César Fobos, líder do Governo e do Senado. Inúmeros Cruzudores da União Koopa iniciaram uma ofensiva contra o coração da Novíssima República, algo que não tinha acontecido desde o início das Guerras Replóides. Centenas de Aeróstatos de Ataque e milhares de Caças Koopa atacaram a Frota da Novíssima República estacionada na atmosfera acima de Coruscante, formada principalmente por Destróieres Estrelares Classe-Venator e Caças Tipo Arca-170. A Cidade Galáctica foi invadida Soldados Koopa e Orcos Uruk-hai, ambos da União Koopa, Orcos e os terroristas do Rajada na Escuridão, causando pânico entre a população do planeta. Coube aos grupos de Cavaleiros e Mestres Jedi formar uma resistência e coordenar a defesa planetária. Entre eles estavam os Mestres Jedi Yoda e Antônio Marte, membros do Alto Conselho Jedi. Durante o ataque, as defesas do planeta foram inteiramente concentradas no ataque surpresa do Exército do Rajada na Escuridão, O Grande General Nickayos se infiltrou no Escritório do Supremo Chanceler José Fobos e o raptou. Um pelotão de Tropas Replóides do Exército da Novíssima República, liderado por três Mestres Jedi, incluindo o Mestre Agen Kolar, conseguiram libertar Fobos e levá-lo para longe de seus aposentos, mas nesse processo perderam uma dúzia de Replóides. Fobos foi levado pra as ruas de Coruscante perseguido continuamente pelo Grande General Nickayos, como também grupos de Soldados Koopas e Orcos, até um abrigo subterrâneo, centenas de metros abaixo da superfície. Lá, para a surpresa dos Mestres Jedi, eles foram emboscados pelo Grande General Nickayos, e morreram todos. O Mestre Jedi Agen Kolar, que tinha ficado para trás para proteger a fuga do Supremo Chanceler, veio para o abrigo apenas para saber da morte de seus companheiros Jedi, e a captura de Fobos por Nickayos. Enquanto a defesa da cidade estava lutando em suas ruas e arranha-céus, mas, estranhamente, o Exército Koopa não parecia interessado em tomar posições-chave, como o Senado ou o Templo Jedi. Sua estratégia era estranha pelo modo definido por Antônio Marte e Yoda sobre as verdadeiras intenções de Nickayos, isto é, a captura de Fobos. Assim, o Mestre Marte foi separado de sua principal linha de defesa e caminhou rapidamente para o abrigo para atender o chamado de Agen Kolar e encontrá-lo lá sem o Supremo Chanceler. Nickayos tinha conseguido escapar com Fobos. Mas antes que pudesse decolar, Mestre Marte conseguiu acertar sua armadura usando um truque da Força. No espaço, a notícia da captura do Supremo Chanceler José Fobos se espalha e as Tropas Replóides, comandadas por Liana May Xiang e Maria Isabel Samara que usam Caças Estrelares Jedi, lideraram uma operação de resgate e conseguem se infiltrar no Cruzador Mancha Negra, da Frota do Rajada na Escuridão. A bordo da nave, elas encontraram o Supremo Chanceler José Fobos mantidos pelo Lorde Sith, Darth Mysteris, mais conhecido como Doutor Doom. Depois de uma violenta luta com Sabres-de-luz, Maria Samara derrotou e matou o Doutor Doom salvando o Chanceler. Perto do fim das Guerras Replóides, Maria Isabel Samara se volta contra os Jedi e se une a José Fobos. Eles matam Antônio Marte e usam uma falsa conspiração Jedi para executar Ordem 666, que fazem as Tropas Replóides atacarem seus respectivos Mestres e Generais Jedi em Batalha como Liana May e Yoda. Depois com a queda do grupo Rajada na Escuridão. José usa a Declaração de uma Terceira Ordem, reorganizando a Novíssima República Galáctica no Terceiro Império Galáctico.
Em honra do novo governo, o Setor Coruscante foi renomeado Setor do Terceiro Império, Coruscante em si foi renomeado Centro do Terceiro Império e a Cidade Galáctica foi renomeada Cidade do Terceiro Império. O Senado Galáctico se tornou o Senado do Terceiro Império. O Exército Principal da Novíssima República se tornou o Exército do Terceiro Império e a Marinha da Novíssima República se tornou a Marinha do Terceiro Império. As quatro agências de inteligência decrépitas da Novíssima República foram divididas em Comando de Defesa do Terceiro Império (CDTI), antigo Comando de Defesa da Novíssima República (CDNOR), que era chefiado por Cruella Vandroni, o CDTI continuava sendo comandado por ele. O Palácio da Novíssima República foi reconstruído e ampliado, tornando-se o Palácio do Terceiro Império, encobrindo todas as outras construções em volta do Centro do Terceiro Império. A antiga Comissão para a Proteção da Novíssima República (CPNOR) foi renomeada a Comissão para a Preservação da Terceira Ordem, ou (CPTO), dentro de dias, havia poucos nomes que lembravam a população que aquilo havia sido uma Novíssima República. Grandes coordenadores projetaram e manufaturaram a construção de grandes dróides do tamanho de Aeróstatos. Estes autômatos gigantescos esmagariam os velhos edifícios, usando suas muitas partes, correias transportadoras e braços mecânicos. Das partes recicláveis desses velhos edifícios eles construiriam um novo edifício. Outras estruturas da Novíssima República, como o Senado Galáctico da Novíssima República e o Templo Jedi, foram fechadas e cercadas.
Durante as Guerras Mavericks, Coruscante foi alvo do domínio de Mestres Replóides controlados pelo Doutor Alberto Guilherme, mas a maioria foi derrotada por Rock Samara em suas bases situadas em Reatores Solares. Doutor Tomé Luz também passou várias vezes aqui para colocar cápsulas para serem usadas por Rock Samara cem anos mais tarde. Tomé depois foi morto em um atentado orquestrado pelo Imperador José Fobos após Darth Mama enfrentar e matar Doutor Guilherme na Arma Final na órbita de Byss. Cem anos mais tarde, vários outros Mestres Replóides desta vez comandados por Sigma foram colocados em Coruscante como Dragão Magma. Dragão Magma criou um atentado terrorista de Falsa Bandeira contra os povos oprimidos de Coruscante na Cidade Lagoa Estrelada. Lagoa Estrelada foi destruída, mas Dragão Magma foi depois derrotado por Rock Samara e o Replóide Zero. Rock Samara e Zero voltariam aqui para outros desafios enfrentando Mavericks da AS.
Uma vez, Von Bowser tentou capturar Mário Jorge na Cidade Galáctica e teve êxito, mas fracassou depois como os amigos e irmãos de Mário Jorge vieram resgatá-lo de Bowser. Durante a Batalha do Monumento Central, o Núcleo de Fantomile foi destruído por Mário Jorge, um dos filhos de Mama. Mama volta para Coruscante e é repreendida pelo Imperador. Foi uma vitória histórica para a Revolução e dividiu o Calendário da Galáxia. Mário Jorge mais tarde tornou-se alvo da Rainha Maria, líder do Sol Negro (Uma organização criminosa que existia nos arredores e periferias de Coruscante). Maria tentou usar do afeto de Mário e Luigi para tentar de destruir a imagem de Darth Mama com o Imperador. Mas Maria falhou e foi capturada por Mama em Coruscante. Mais tarde Mário e suas irmãs Samus e Sara Liliana libertam Maria de Mama. Eles tentam com o Sol Negro derrubar o domínio do Terceiro Império no planeta. Mas Darth Mama matou Maria em uma explosão nas bases do Sol Negro em Coruscante e Mário teve que fugir com a ajuda de seus irmãos e amigos. O Sol Negro foi dissolvido temporariamente após a morte de Maria.
Após a morte de José Fobos e Darth Mama na Batalha de Romano em 5 anos DBMC, uma insurreição aconteceu em Coruscante. Bilhões de cidadãos de Coruscante comemoraram seu novo estado de liberdade, e um levante armado irrompeu das áreas habitadas por não-humanos. Patrulhas de Fantomtropas atacaram as ruas e estátuas de Fobos foram derrubadas junto com outros símbolos do Terceiro Império que foram profanados. No meio de toda a celebração e distúrbios, as autoridades ordenaram uma repressão aos revolucionários e medidas extremas de restrição contra a população da Cidade Galáctica dando poder total aos militares para acabar com a revolta e restaurar a ordem. A retaliação militar foi horrenda e o número de mortes aumentou até o Terceiro Império matar todos os insurgentes e colocando a população sob seu controle.
Em seguida, o Grande Vizier Cara-Pálida Sate Pestage assumiu o Centro do Terceiro Império. Infelizmente, ele tinha se oposto a ex-diretores de Fobos que formavam o Círculo Interno. Elza Enxameai agiu como uma intermediária neutra entre as duas facções opostas. Infelizmente para eles, ela havia os colocado uns contra os outros e escondeu que ela queria ser Imperatriz, mas nenhum dos lados percebeu as verdadeiras intenções dela, até ser tarde demais. Ela finalmente assumiu o Centro do Terceiro Império em 6 anos ABMC, embora seu reinado fosse atormentado por ameaças de Senhores da Guerra rivais e a expansão da República Federativa da Galáxia. Lutando para manter o controle e atingir seus objetivos, ela ordenou a uma equipe de cientistas, incluindo Evir Derricote para criar um vírus artificial conhecido como DIV que só afetavam a espécie Krytos e outras espécies exóticas poluindo os tanques de água.
No final de 8 anos DBMC o famoso Esquadrão Valente de caças sob a liderança de Den Walshi foi secretamente enviado para se infiltrar e sabotar o poderoso Gerador de Escudo do planeta Coruscante. Para fazer isso, eles seqüestraram um Dróide Trabalhador EV e o usou para transportá-los para um centro de operações, onde desviaram um dos espelhos orbitais para condensar uma grande quantidade de reserva de água. Criando uma poderosa tempestade penetrou nos escudos. Isto permitiu que a Frota da República Federativa da Galáxia entrasse no sistema Coruscante e tomasse a capital galáctica.
No entanto, durante os dias de vitória, milhões de não-humanos de Coruscante como os Krytos começaram a morrer devido ao vírus. Desde que somente os humanos eram imunes ao vírus, que gerou um rombo entre as espécies na República Federativa da Galáxia . Mas como se isso não bastasse, Elza usou o Lusankya para escapar de Coruscante em direção ao hiperespaço para escapar para o planeta Thyferra apesar dos esforços do Esquadrão Valente. Na decolagem, a Lusankya causou uma grande devastação na superfície do planeta, matando milhões de pessoas instantaneamente. A onda de choque passou por dois escudos planetários, parando no fogo interplanetário contra o Canhão de Defesa Espacial Golano III antes de escapar do sistema Coruscante. Mais tarde, os cientistas da República Federativa da Galáxia desenvolveram uma cura para o vírus para os Krytos nos tanques Bactas usando uma mistura de várias especiarias ryll, conhecidas como kor. Isso evitou mais perdas de vidas alienígenas, embora as relações entre as espécies permanecessem um tanto transtornadas por algum tempo.
A Cidade Galáctica foi renomeada como Cidade de Samara e o nome Centro do Terceiro Império foi abandonado. Depois de Elza partir de Coruscante retirando-se para Thyferra, uma fragmentação profunda dentro do Terceiro Império fez o Terceiro Império e o CDTI perderem a fé em seus líderes. Os líderes do Círculo Interno do Terceiro Império foram encontrados, mais uma vez, exercendo uma autoridade fraca e centraizadora para o Terceiro Império. Eles apoiaram o Grande Almirante Cara-Pálida Chiss Thrawn como seu Comandante Supremo, erroneamente acreditando que como alienígena e sem prestígio, seu mundo era rarefeito politicamente, ele necessariamente devia se sentir em dívida com seus patrocinadores e seu governo.
Em 9 anos DBMC, Coruscante foi visitado pelo Consórcio Hapes que cercou o planeta com uma Frota de Dragões de Combate Hapanos, realizando pela primeira vez em milênios, o primeiro contato significativo com esta sociedade insular efetuou com o resto da Galáxia desde que o Consórcio fechou as fronteiras por volta de 3100 anos ABY. Na Grande Sala de Recepção, os administradores hapanos presentearam a República Federativa da Galáxia com muitos e magníficas regalias incluindo vários Aeróstatos e Destróieres Estrelares do Terceiro Império.